Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Fndc1E9Q043 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Fndc1E9Q043 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Fndc1E9Q043 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Fndc1E9Q043 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Fndc1E9Q043 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Fndc1E9Q043 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Fndc1E9Q043 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Fndc1E9Q043 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Fndc1E9Q043 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Fndc1E9Q043 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Fndc1E9Q043 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Fndc1E9Q043 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Fndc1E9Q043 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Fndc1E9Q043 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Fndc1E9Q043 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Fndc1E9Q043 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Fndc1E9Q043 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Fndc1E9Q043 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Fndc1E9Q043 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Fndc1E9Q043 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Fndc1E9Q043 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Fndc1E9Q043 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Fndc1E9Q043 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Fndc1E9Q043 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Fndc1E9Q043 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Fndc1E9Q043 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Fndc1E9Q043 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Fndc1E9Q043 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Fndc1E9Q043 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Fndc1E9Q043 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Fndc1E9Q043 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Fndc1E9Q043 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Fndc1E9Q043 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Fndc1E9Q043 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fndc1E9Q043 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fndc1E9Q043 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fndc1E9Q043 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fndc1E9Q043 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fndc1E9Q043 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fndc1E9Q043 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fndc1E9Q043 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fndc1E9Q043 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fndc1E9Q043 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fndc1E9Q043 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Fndc1E9Q043 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Fndc1E9Q043 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Fndc1E9Q043 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Fndc1E9Q043 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Fndc1E9Q043 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Fndc1E9Q043 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Fndc1E9Q043 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms