Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms