Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms