Protein–RNA interactions for Protein: E9PVP9

Gm4884, Predicted gene 4884, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4884E9PVP9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm4884E9PVP9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm4884E9PVP9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm4884E9PVP9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm4884E9PVP9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm4884E9PVP9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm4884E9PVP9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm4884E9PVP9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm4884E9PVP9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm4884E9PVP9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm4884E9PVP9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm4884E9PVP9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm4884E9PVP9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm4884E9PVP9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm4884E9PVP9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm4884E9PVP9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm4884E9PVP9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm4884E9PVP9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm4884E9PVP9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm4884E9PVP9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm4884E9PVP9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm4884E9PVP9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm4884E9PVP9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm4884E9PVP9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm4884E9PVP9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms