Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Clca3bE9PUL3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms