Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ38

Gm45062, Predicted gene 45062, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm45062E0CZ38 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm45062E0CZ38 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm45062E0CZ38 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm45062E0CZ38 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm45062E0CZ38 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm45062E0CZ38 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm45062E0CZ38 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm45062E0CZ38 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm45062E0CZ38 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm45062E0CZ38 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm45062E0CZ38 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm45062E0CZ38 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm45062E0CZ38 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm45062E0CZ38 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm45062E0CZ38 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm45062E0CZ38 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm45062E0CZ38 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm45062E0CZ38 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm45062E0CZ38 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm45062E0CZ38 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm45062E0CZ38 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm45062E0CZ38 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm45062E0CZ38 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm45062E0CZ38 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm45062E0CZ38 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm45062E0CZ38 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm45062E0CZ38 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm45062E0CZ38 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm45062E0CZ38 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm45062E0CZ38 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm45062E0CZ38 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm45062E0CZ38 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm45062E0CZ38 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm45062E0CZ38 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm45062E0CZ38 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm45062E0CZ38 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm45062E0CZ38 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm45062E0CZ38 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm45062E0CZ38 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm45062E0CZ38 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm45062E0CZ38 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms