Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim12cD3Z3L3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim12cD3Z3L3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim12cD3Z3L3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim12cD3Z3L3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim12cD3Z3L3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim12cD3Z3L3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim12cD3Z3L3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim12cD3Z3L3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim12cD3Z3L3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim12cD3Z3L3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim12cD3Z3L3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim12cD3Z3L3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim12cD3Z3L3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim12cD3Z3L3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim12cD3Z3L3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim12cD3Z3L3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim12cD3Z3L3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim12cD3Z3L3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim12cD3Z3L3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim12cD3Z3L3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim12cD3Z3L3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim12cD3Z3L3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim12cD3Z3L3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim12cD3Z3L3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim12cD3Z3L3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim12cD3Z3L3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim12cD3Z3L3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim12cD3Z3L3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim12cD3Z3L3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim12cD3Z3L3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim12cD3Z3L3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim12cD3Z3L3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim12cD3Z3L3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim12cD3Z3L3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim12cD3Z3L3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim12cD3Z3L3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim12cD3Z3L3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim12cD3Z3L3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim12cD3Z3L3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim12cD3Z3L3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim12cD3Z3L3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim12cD3Z3L3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim12cD3Z3L3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim12cD3Z3L3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim12cD3Z3L3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim12cD3Z3L3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim12cD3Z3L3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim12cD3Z3L3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim12cD3Z3L3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trim12cD3Z3L3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trim12cD3Z3L3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim12cD3Z3L3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim12cD3Z3L3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim12cD3Z3L3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim12cD3Z3L3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim12cD3Z3L3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim12cD3Z3L3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim12cD3Z3L3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim12cD3Z3L3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim12cD3Z3L3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim12cD3Z3L3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim12cD3Z3L3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim12cD3Z3L3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim12cD3Z3L3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim12cD3Z3L3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim12cD3Z3L3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim12cD3Z3L3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim12cD3Z3L3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim12cD3Z3L3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim12cD3Z3L3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim12cD3Z3L3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim12cD3Z3L3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim12cD3Z3L3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim12cD3Z3L3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim12cD3Z3L3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim12cD3Z3L3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim12cD3Z3L3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim12cD3Z3L3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim12cD3Z3L3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim12cD3Z3L3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim12cD3Z3L3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim12cD3Z3L3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim12cD3Z3L3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim12cD3Z3L3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim12cD3Z3L3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim12cD3Z3L3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim12cD3Z3L3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim12cD3Z3L3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim12cD3Z3L3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim12cD3Z3L3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim12cD3Z3L3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim12cD3Z3L3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim12cD3Z3L3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim12cD3Z3L3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim12cD3Z3L3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim12cD3Z3L3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim12cD3Z3L3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim12cD3Z3L3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim12cD3Z3L3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms