Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms