Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms