Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
Abcc8B2RUS7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Abcc8B2RUS7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Abcc8B2RUS7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
Abcc8B2RUS7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Abcc8B2RUS7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
Abcc8B2RUS7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Abcc8B2RUS7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
Abcc8B2RUS7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Abcc8B2RUS7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Abcc8B2RUS7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Abcc8B2RUS7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Abcc8B2RUS7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Abcc8B2RUS7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Abcc8B2RUS7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Abcc8B2RUS7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Abcc8B2RUS7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Abcc8B2RUS7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
Abcc8B2RUS7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Abcc8B2RUS7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Abcc8B2RUS7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
Abcc8B2RUS7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Abcc8B2RUS7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Abcc8B2RUS7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Abcc8B2RUS7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Abcc8B2RUS7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Abcc8B2RUS7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Abcc8B2RUS7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
Abcc8B2RUS7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Abcc8B2RUS7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Abcc8B2RUS7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Abcc8B2RUS7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Abcc8B2RUS7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Abcc8B2RUS7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
Abcc8B2RUS7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Abcc8B2RUS7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Abcc8B2RUS7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Abcc8B2RUS7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Abcc8B2RUS7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Abcc8B2RUS7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Abcc8B2RUS7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Abcc8B2RUS7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Abcc8B2RUS7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Abcc8B2RUS7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Abcc8B2RUS7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Abcc8B2RUS7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Abcc8B2RUS7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Abcc8B2RUS7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Abcc8B2RUS7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
Abcc8B2RUS7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Abcc8B2RUS7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Abcc8B2RUS7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Abcc8B2RUS7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Abcc8B2RUS7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Abcc8B2RUS7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Abcc8B2RUS7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Abcc8B2RUS7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Abcc8B2RUS7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
Abcc8B2RUS7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Abcc8B2RUS7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Abcc8B2RUS7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
Abcc8B2RUS7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Abcc8B2RUS7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Abcc8B2RUS7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Abcc8B2RUS7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Abcc8B2RUS7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
Abcc8B2RUS7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Abcc8B2RUS7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Abcc8B2RUS7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Abcc8B2RUS7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Abcc8B2RUS7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Abcc8B2RUS7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
Abcc8B2RUS7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
Abcc8B2RUS7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Abcc8B2RUS7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Abcc8B2RUS7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
Abcc8B2RUS7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Abcc8B2RUS7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Abcc8B2RUS7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Abcc8B2RUS7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Abcc8B2RUS7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Abcc8B2RUS7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Abcc8B2RUS7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Abcc8B2RUS7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Abcc8B2RUS7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
Abcc8B2RUS7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Abcc8B2RUS7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Abcc8B2RUS7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC36.32■■■■□ 3.41
Abcc8B2RUS7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC36.32■■■■□ 3.41
Abcc8B2RUS7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.41
Abcc8B2RUS7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.41
Abcc8B2RUS7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Abcc8B2RUS7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Abcc8B2RUS7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Abcc8B2RUS7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Abcc8B2RUS7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Abcc8B2RUS7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
Abcc8B2RUS7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Abcc8B2RUS7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Abcc8B2RUS7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms