Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.6 ms