Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprbB2RU80 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms