Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms