Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms