Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NhsB1AV60 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NhsB1AV60 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NhsB1AV60 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NhsB1AV60 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NhsB1AV60 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NhsB1AV60 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NhsB1AV60 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NhsB1AV60 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NhsB1AV60 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NhsB1AV60 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NhsB1AV60 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NhsB1AV60 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NhsB1AV60 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NhsB1AV60 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NhsB1AV60 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NhsB1AV60 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NhsB1AV60 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NhsB1AV60 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NhsB1AV60 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
NhsB1AV60 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NhsB1AV60 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NhsB1AV60 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NhsB1AV60 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NhsB1AV60 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NhsB1AV60 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NhsB1AV60 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NhsB1AV60 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NhsB1AV60 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NhsB1AV60 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NhsB1AV60 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NhsB1AV60 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NhsB1AV60 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NhsB1AV60 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NhsB1AV60 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms