Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms