Protein–RNA interactions for Protein: A2RSL7

4931406B18Rik, RIKEN cDNA 4931406B18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931406B18RikA2RSL7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
4931406B18RikA2RSL7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
4931406B18RikA2RSL7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
4931406B18RikA2RSL7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
4931406B18RikA2RSL7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
4931406B18RikA2RSL7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
4931406B18RikA2RSL7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
4931406B18RikA2RSL7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
4931406B18RikA2RSL7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4931406B18RikA2RSL7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
4931406B18RikA2RSL7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4931406B18RikA2RSL7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4931406B18RikA2RSL7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4931406B18RikA2RSL7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4931406B18RikA2RSL7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4931406B18RikA2RSL7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
4931406B18RikA2RSL7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4931406B18RikA2RSL7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4931406B18RikA2RSL7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4931406B18RikA2RSL7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4931406B18RikA2RSL7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
4931406B18RikA2RSL7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4931406B18RikA2RSL7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4931406B18RikA2RSL7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4931406B18RikA2RSL7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4931406B18RikA2RSL7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
4931406B18RikA2RSL7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4931406B18RikA2RSL7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4931406B18RikA2RSL7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4931406B18RikA2RSL7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4931406B18RikA2RSL7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
4931406B18RikA2RSL7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4931406B18RikA2RSL7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4931406B18RikA2RSL7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4931406B18RikA2RSL7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4931406B18RikA2RSL7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4931406B18RikA2RSL7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4931406B18RikA2RSL7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4931406B18RikA2RSL7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4931406B18RikA2RSL7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4931406B18RikA2RSL7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4931406B18RikA2RSL7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4931406B18RikA2RSL7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4931406B18RikA2RSL7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4931406B18RikA2RSL7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4931406B18RikA2RSL7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4931406B18RikA2RSL7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4931406B18RikA2RSL7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4931406B18RikA2RSL7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4931406B18RikA2RSL7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4931406B18RikA2RSL7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
4931406B18RikA2RSL7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms