Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms