Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CtcflA2APF3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms