Protein–RNA interactions for Protein: A2A3U9

Gm6268, Predicted gene 6268, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6268A2A3U9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms