Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms