Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Olfr1377-201ENSMUST00000075177 1063 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Olfr1427-201ENSMUST00000087825 938 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 BC061195-201ENSMUST00000088133 577 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 1700003E24Rik-201ENSMUST00000088134 577 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Scn11a-202ENSMUST00000215718 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Cdh8-204ENSMUST00000142129 2711 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Gm19801-201ENSMUST00000218231 1882 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Gm10727-201ENSMUST00000197107 1602 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Gm18716-201ENSMUST00000204507 1603 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Cfap44-202ENSMUST00000120049 6199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Olfr821-202ENSMUST00000205181 1993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Gm44684-201ENSMUST00000205388 2926 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Rimklb-206ENSMUST00000204731 3039 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Prex2-201ENSMUST00000027056 11053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Gm30340-201ENSMUST00000191898 2198 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Zfp90-205ENSMUST00000212874 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Tacc2-202ENSMUST00000059145 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Gm43219-201ENSMUST00000197972 1937 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Gm35808-201ENSMUST00000204769 2602 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Etl4-205ENSMUST00000114607 3055 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Gm13415-201ENSMUST00000131886 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Vegfd-201ENSMUST00000033751 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Olfr113-201ENSMUST00000216181 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Tg-201ENSMUST00000065916 8454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Daw1-202ENSMUST00000065436 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Ctbp2-214ENSMUST00000169570 3604 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Iars-206ENSMUST00000165316 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 2610020C07Rik-201ENSMUST00000181526 2925 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Ociad1-203ENSMUST00000166823 3354 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Chid1-207ENSMUST00000153191 4182 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Ppp1r42-201ENSMUST00000027049 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Aplnr-201ENSMUST00000057019 3699 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Gucy1a3-201ENSMUST00000048976 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Fmr1-206ENSMUST00000114657 4076 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Dusp18-201ENSMUST00000055931 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Fmo5-203ENSMUST00000107050 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Samd3-206ENSMUST00000220219 1744 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Gm5793-201ENSMUST00000119393 630 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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SrfQ9JM73 Gm22642-201ENSMUST00000175352 252 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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SrfQ9JM73 1700030L22Rik-202ENSMUST00000222223 704 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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SrfQ9JM73 AC137871.2-201ENSMUST00000226482 289 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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SrfQ9JM73 Morn5-201ENSMUST00000028256 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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SrfQ9JM73 Ugt2a3-201ENSMUST00000031195 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Trps1-206ENSMUST00000184458 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Ehbp1-201ENSMUST00000045167 4821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Zfp661-202ENSMUST00000110366 4912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Ctnnd1-224ENSMUST00000111698 5850 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Pigr-201ENSMUST00000027675 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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SrfQ9JM73 Eif4a2-202ENSMUST00000077605 2708 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Gm3234-201ENSMUST00000222644 5061 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Gm6614-201ENSMUST00000111832 1953 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Trim38-203ENSMUST00000226039 1999 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Slitrk4-201ENSMUST00000069926 8494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Slc24a2-202ENSMUST00000107155 2171 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Zbtb44-202ENSMUST00000167346 1308 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 A330087D11Rik-201ENSMUST00000187265 1334 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 AC132596.1-201ENSMUST00000223043 2263 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Trim2-202ENSMUST00000065380 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Ece2-207ENSMUST00000079600 3349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Gsdmc3-201ENSMUST00000089894 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Gm37911-201ENSMUST00000193099 1545 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Zfp551-201ENSMUST00000080348 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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