Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Cxcr6-202ENSMUST00000216072 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm42873-201ENSMUST00000196110 1726 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Tfb1m-201ENSMUST00000041003 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm17690-201ENSMUST00000180958 3467 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Olfr1250-202ENSMUST00000111527 4386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm14529-201ENSMUST00000117894 406 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 1700047A11Rik-201ENSMUST00000144750 427 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm24687-201ENSMUST00000157758 241 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm26167-201ENSMUST00000158423 253 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 1700006E09Rik-203ENSMUST00000176722 608 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm5128-202ENSMUST00000180198 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 1700109K24Rik-201ENSMUST00000181870 1045 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Mir6992-201ENSMUST00000183342 109 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Mir6361-201ENSMUST00000185079 101 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 4933436F18Rik-201ENSMUST00000193468 802 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm6631-201ENSMUST00000193699 559 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm43470-201ENSMUST00000196175 454 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Trav3n-2-201ENSMUST00000197693 334 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Trav3d-2-201ENSMUST00000199874 334 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm45054-201ENSMUST00000206525 342 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm38584-201ENSMUST00000207361 517 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm4548-201ENSMUST00000208487 509 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm7499-201ENSMUST00000210423 813 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm45246-201ENSMUST00000210820 367 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 AC155941.1-201ENSMUST00000220223 529 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 AC091783.2-201ENSMUST00000224626 740 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 AC159205.4-201ENSMUST00000225964 704 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Klrd1-201ENSMUST00000032268 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Rpgrip1l-201ENSMUST00000047783 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm43874-201ENSMUST00000204853 2798 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Stk32a-201ENSMUST00000045477 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Zfp60-201ENSMUST00000042641 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm9314-201ENSMUST00000199881 1528 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Vmn1r15-201ENSMUST00000228297 2021 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm10220-201ENSMUST00000088236 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Pkn2-210ENSMUST00000174422 2904 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm43637-201ENSMUST00000202206 2926 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Cyp2j13-201ENSMUST00000030305 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Exph5-201ENSMUST00000051014 5957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Ift80-201ENSMUST00000029347 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Ankrd55-205ENSMUST00000223871 3209 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm25564-201ENSMUST00000104604 132 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 B4galt4-202ENSMUST00000114708 734 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm11821-201ENSMUST00000117335 979 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm14712-201ENSMUST00000120195 772 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Mir6921-201ENSMUST00000183719 80 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Mir6952-201ENSMUST00000185092 61 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm42880-201ENSMUST00000198028 459 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm31211-201ENSMUST00000199170 253 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm44422-201ENSMUST00000204142 1025 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm44239-201ENSMUST00000204228 271 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm44984-201ENSMUST00000207802 394 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm6009-201ENSMUST00000210848 280 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 4933404K13Rik-201ENSMUST00000214651 937 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm18789-201ENSMUST00000216115 550 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 AC132121.1-201ENSMUST00000220774 332 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 AC159208.1-201ENSMUST00000221403 649 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm40653-202ENSMUST00000222122 1155 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 AC156559.2-201ENSMUST00000224403 384 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Olfr266-201ENSMUST00000059486 1027 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 BC061195-201ENSMUST00000088133 577 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 1700003E24Rik-201ENSMUST00000088134 577 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm12057-201ENSMUST00000117244 1427 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm3183-202ENSMUST00000201703 2048 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Olfr453-202ENSMUST00000213997 3082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Pja2-201ENSMUST00000024888 4531 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Serpinb6c-202ENSMUST00000172184 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Slamf6-201ENSMUST00000171330 2485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Mir700-201ENSMUST00000102169 79 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Cnga3Q9JJZ8 Mir449c-201ENSMUST00000102192 109 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
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