Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 9530003O04Rik-201ENSMUST00000192663 908 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm37190-201ENSMUST00000193580 688 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 9430087J23Rik-201ENSMUST00000195414 1152 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Igkv4-73-201ENSMUST00000199760 358 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm30708-201ENSMUST00000202183 312 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm5318-201ENSMUST00000205249 406 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm45272-202ENSMUST00000209875 502 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm45479-201ENSMUST00000211613 802 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm45486-201ENSMUST00000211767 1109 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Amd-ps6-201ENSMUST00000214455 1003 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 AC166352.1-201ENSMUST00000215483 1105 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 AC131743.3-201ENSMUST00000222099 662 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 CT030645.3-201ENSMUST00000225483 1022 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm15500-201ENSMUST00000071523 894 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 mt-Nd1-201ENSMUST00000082392 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm22581-201ENSMUST00000083735 136 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Zfp850-201ENSMUST00000099111 941 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Vmn1r201-202ENSMUST00000226330 4770 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 AC166358.5-201ENSMUST00000220706 1302 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm3476-202ENSMUST00000167913 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm3629-201ENSMUST00000171706 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm3149-202ENSMUST00000171810 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Meis1-208ENSMUST00000177417 5308 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 4732465J04Rik-202ENSMUST00000187483 2744 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm19210-201ENSMUST00000199562 1350 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Themis-203ENSMUST00000105516 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm37289-201ENSMUST00000195409 1402 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Dnajc15-202ENSMUST00000226459 6193 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gje1-201ENSMUST00000020016 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Lpar6-201ENSMUST00000044405 5400 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm37911-201ENSMUST00000193099 1545 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Galntl6-207ENSMUST00000204067 1592 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm18716-201ENSMUST00000204507 1603 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Akr1e1-202ENSMUST00000110691 3288 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 6330410L21Rik-201ENSMUST00000199846 3871 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Pkn2-206ENSMUST00000173830 2808 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm38096-201ENSMUST00000193692 2389 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Igkv18-36-201ENSMUST00000103373 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm26144-201ENSMUST00000104475 132 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Apoa2-203ENSMUST00000111320 470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Apoa2-204ENSMUST00000111321 518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm14510-201ENSMUST00000116165 1092 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm16074-201ENSMUST00000119524 444 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm12094-201ENSMUST00000121781 472 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Scgb2b23-ps-201ENSMUST00000122094 330 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 2310081O03Rik-201ENSMUST00000128591 759 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Tmem132cos-202ENSMUST00000154361 699 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm23553-201ENSMUST00000157817 295 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Vmn1r176-201ENSMUST00000171073 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Vmn1r-ps141-201ENSMUST00000176293 753 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm6526-202ENSMUST00000179860 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Mir7685-201ENSMUST00000183555 62 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm28080-201ENSMUST00000188552 722 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm21524-201ENSMUST00000190499 696 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm21715-201ENSMUST00000191056 694 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Fabp9-202ENSMUST00000191678 647 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm18717-201ENSMUST00000192744 1241 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm37177-201ENSMUST00000193768 417 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm37838-201ENSMUST00000194464 312 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm32158-201ENSMUST00000200135 404 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm44984-201ENSMUST00000207802 394 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm34263-202ENSMUST00000214353 303 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm19169-201ENSMUST00000220109 1246 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Olfr1354-201ENSMUST00000075859 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Olfr678-201ENSMUST00000098160 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Matr3-ps2-201ENSMUST00000160839 1996 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Vwc2l-201ENSMUST00000053922 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Zranb2-202ENSMUST00000106057 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Pcdh11x-203ENSMUST00000113364 4454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm8700-201ENSMUST00000222187 3054 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.5 ms