Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Trbv20-201ENSMUST00000103277 335 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Zcchc9-ps-201ENSMUST00000117884 786 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm8624-201ENSMUST00000118083 432 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm13877-201ENSMUST00000120614 417 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm12472-201ENSMUST00000153232 1140 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm23441-201ENSMUST00000157268 127 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm24532-201ENSMUST00000157951 286 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm16563-201ENSMUST00000162673 423 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Zfp169-202ENSMUST00000167682 411 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm17655-201ENSMUST00000167969 255 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Olfr102-201ENSMUST00000169373 1027 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r-ps71-201ENSMUST00000172648 924 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm4308-201ENSMUST00000179735 914 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm4301-201ENSMUST00000186197 914 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 4930554C24Rik-201ENSMUST00000187735 1084 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Scgb1b8-ps-201ENSMUST00000189652 249 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm4312-201ENSMUST00000190264 914 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm38141-201ENSMUST00000192540 317 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm6680-201ENSMUST00000192789 950 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm37620-201ENSMUST00000192910 501 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm38084-201ENSMUST00000193488 437 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm37865-201ENSMUST00000194996 437 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm42720-201ENSMUST00000196813 300 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 S100a6-203ENSMUST00000198128 464 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 5033423K11Rik-202ENSMUST00000202802 1162 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm43929-201ENSMUST00000203025 409 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm44693-201ENSMUST00000208141 460 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm45279-201ENSMUST00000210315 391 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm45607-201ENSMUST00000211143 678 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm45551-201ENSMUST00000211459 928 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 AC122905.1-201ENSMUST00000218181 456 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 AC122539.1-201ENSMUST00000219925 329 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 AC163621.3-201ENSMUST00000221738 1033 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Mif-ps7-201ENSMUST00000223357 327 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 AC167192.1-201ENSMUST00000225908 139 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Mir455-201ENSMUST00000093594 82 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Krtap14-201ENSMUST00000099562 216 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Olfr1040-201ENSMUST00000099909 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Il18r1-201ENSMUST00000087983 2826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Pde4b-207ENSMUST00000106908 4304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm43229-201ENSMUST00000201812 1850 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm9602-201ENSMUST00000163325 2062 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm8356-201ENSMUST00000163636 2062 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm38377-201ENSMUST00000193253 3772 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm7869-201ENSMUST00000121457 1322 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm27013-202ENSMUST00000205067 1436 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Meiob-201ENSMUST00000024972 1703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Zfp184-201ENSMUST00000006903 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Olfr1564-202ENSMUST00000208645 5213 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm25546-201ENSMUST00000103977 132 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Sult2a4-201ENSMUST00000108520 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm12306-201ENSMUST00000117256 171 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm11991-201ENSMUST00000119652 1074 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Mrpl48-ps-201ENSMUST00000121413 636 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm14353-201ENSMUST00000122200 869 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm15584-201ENSMUST00000123231 759 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm24359-201ENSMUST00000158418 221 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Airn-202ENSMUST00000159731 435 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm17043-201ENSMUST00000164621 1283 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Olfr331-202ENSMUST00000170501 957 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Lsm5-203ENSMUST00000176595 274 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm24925-201ENSMUST00000178157 107 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm2877-201ENSMUST00000178248 1204 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm8324-201ENSMUST00000178911 1204 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Mir8114-201ENSMUST00000183582 111 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 1700041C23Rik-201ENSMUST00000185243 395 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm29513-201ENSMUST00000185741 202 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm9114-201ENSMUST00000188558 997 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 1700112H15Rik-201ENSMUST00000188766 778 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Oaz3-201ENSMUST00000191506 732 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 4930433B08Rik-201ENSMUST00000192010 644 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm37000-201ENSMUST00000193058 428 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Olfr1409-ps1-201ENSMUST00000194013 252 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm37989-201ENSMUST00000195202 803 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm44006-201ENSMUST00000204273 396 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms