Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Olfr1385-202ENSMUST00000214948 4412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm37289-201ENSMUST00000195409 1402 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm38335-201ENSMUST00000195727 1789 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Olfr1382-203ENSMUST00000213707 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Olfr1382-204ENSMUST00000213899 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Olfr1382-205ENSMUST00000217564 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Zfp971-201ENSMUST00000108925 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Fpr3-202ENSMUST00000115565 1220 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm8501-201ENSMUST00000117684 432 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Calr-ps-201ENSMUST00000121776 485 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 1700057H15Rik-201ENSMUST00000127913 595 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm14092-201ENSMUST00000136794 617 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gtsf1-206ENSMUST00000146675 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm13417-201ENSMUST00000155475 533 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Anapc13-202ENSMUST00000186693 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm29385-201ENSMUST00000186831 363 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm29663-201ENSMUST00000186962 853 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm28586-201ENSMUST00000189857 456 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm37189-201ENSMUST00000192131 298 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm43233-201ENSMUST00000200491 616 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Emc2-201ENSMUST00000022962 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Cst12-201ENSMUST00000028932 644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Fpr3-201ENSMUST00000054871 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm24041-201ENSMUST00000083115 156 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Zfp970-201ENSMUST00000099002 794 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm14391-201ENSMUST00000099028 473 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 F830016B08Rik-201ENSMUST00000171297 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Nuf2-202ENSMUST00000111368 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 4930544L04Rik-202ENSMUST00000211181 3204 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm44440-201ENSMUST00000203139 2373 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm14367-201ENSMUST00000119214 1497 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Btbd35f9-201ENSMUST00000178219 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Btbd35f22-201ENSMUST00000178747 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Btbd35f30-201ENSMUST00000179069 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Btbd35f25-201ENSMUST00000179086 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Btbd35f6-201ENSMUST00000179466 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Btbd35f29-201ENSMUST00000179532 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Btbd35f8-201ENSMUST00000180004 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Btbd35f26-201ENSMUST00000180197 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Vmn2r73-201ENSMUST00000077478 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Ankrd34c-201ENSMUST00000060700 5457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Copg2-201ENSMUST00000048774 3961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Zfp638-220ENSMUST00000204751 9033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm20362-201ENSMUST00000204808 2072 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Olfr25-202ENSMUST00000212354 1362 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Mboat2-204ENSMUST00000221952 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm10936-201ENSMUST00000105264 252 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm12026-201ENSMUST00000120961 1024 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm8317-201ENSMUST00000121261 471 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm21990-201ENSMUST00000124692 383 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm15634-201ENSMUST00000147206 492 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm16079-201ENSMUST00000149065 578 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm26046-201ENSMUST00000157312 166 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm23207-201ENSMUST00000158665 102 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm7008-203ENSMUST00000171356 476 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps80-201ENSMUST00000174838 966 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm23617-201ENSMUST00000175410 95 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Scarletltr-201ENSMUST00000176950 305 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm37784-201ENSMUST00000193233 189 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 4933436F18Rik-201ENSMUST00000193468 802 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm44707-201ENSMUST00000206293 1216 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm6009-201ENSMUST00000210848 280 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 AC159297.1-201ENSMUST00000218689 290 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm35890-201ENSMUST00000221195 564 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm9237-201ENSMUST00000221499 548 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 AC140930.1-201ENSMUST00000221889 389 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm33312-201ENSMUST00000222443 332 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Olfr1387-201ENSMUST00000073824 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Olfr1354-201ENSMUST00000075859 1095 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Olfr275-201ENSMUST00000095085 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Vmn2r2-201ENSMUST00000077958 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm42756-201ENSMUST00000196601 2614 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Olfr1155-202ENSMUST00000214641 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Olfr1353-201ENSMUST00000039718 1992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
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