Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 CT025686.2-201ENSMUST00000227898 3315 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Nrcam-201ENSMUST00000020939 4469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Tiam1-213ENSMUST00000163370 7255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Gm37971-201ENSMUST00000193516 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Ncf2-202ENSMUST00000186568 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Smad2-201ENSMUST00000025453 2410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Prdx6b-201ENSMUST00000057072 2885 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Tsr1-201ENSMUST00000045807 3389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Gm14000-201ENSMUST00000118670 233 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Gm12287-201ENSMUST00000119770 707 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Gm12405-201ENSMUST00000141120 660 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Dnaja1-ps-201ENSMUST00000162103 642 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Gm38224-201ENSMUST00000191648 2100 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 CT025616.1-201ENSMUST00000221158 412 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Vmn1r13-201ENSMUST00000078885 903 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Slc38a6-208ENSMUST00000153941 3927 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Olfr675-204ENSMUST00000215899 3737 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Snx10-207ENSMUST00000179365 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Zfp712-201ENSMUST00000167565 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Vmn1r51-201ENSMUST00000072859 2567 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 B130006D01Rik-201ENSMUST00000100534 3124 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 A330015K06Rik-202ENSMUST00000195685 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Epg5-201ENSMUST00000044622 9672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Clasp1-206ENSMUST00000186349 7281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 AC140299.2-201ENSMUST00000219546 1969 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Chrm3-201ENSMUST00000063093 1770 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Hbb-bh3-201ENSMUST00000118954 266 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Rps8-ps1-201ENSMUST00000172445 624 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Rps12-ps24-201ENSMUST00000182321 381 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Oaz3-201ENSMUST00000191506 732 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Gm5554-201ENSMUST00000199726 1206 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Gm3257-201ENSMUST00000207217 675 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Gm45660-201ENSMUST00000210267 151 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Nqo2-201ENSMUST00000021843 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 AC164567.4-201ENSMUST00000219708 483 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Spink13-201ENSMUST00000097557 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Gm8980-201ENSMUST00000140232 2197 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Gm6125-201ENSMUST00000217983 3472 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 A730020M07Rik-202ENSMUST00000196621 2370 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Gm45493-201ENSMUST00000209494 3948 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Atad2-208ENSMUST00000228783 3472 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Traj46-201ENSMUST00000103696 63 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Vmn1r124-201ENSMUST00000105200 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Cd59b-202ENSMUST00000111130 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Fpr3-202ENSMUST00000115565 1220 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Gm12734-201ENSMUST00000120228 948 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Gm13738-201ENSMUST00000122437 469 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Gm24860-201ENSMUST00000158457 276 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 1500015L24Rik-202ENSMUST00000179640 780 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Gm25019-201ENSMUST00000179732 110 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Gm19002-201ENSMUST00000192649 1012 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Gm43712-201ENSMUST00000198020 291 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Gm15839-202ENSMUST00000211219 664 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 AC107757.1-201ENSMUST00000226780 357 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Otor-201ENSMUST00000028902 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Agr3-201ENSMUST00000042101 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Fpr3-201ENSMUST00000054871 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Cyp2j6-201ENSMUST00000030303 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Redrum-201ENSMUST00000181269 1774 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Gm37429-201ENSMUST00000193807 1799 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Gm15428-201ENSMUST00000121352 333 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 1700116B05Rik-201ENSMUST00000173461 414 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Gm29124-201ENSMUST00000186576 452 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
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NischQ80TM9 Olfr1215-201ENSMUST00000188399 943 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 A330069K06Rik-201ENSMUST00000194077 917 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Gm44919-201ENSMUST00000208587 1073 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Gm40692-201ENSMUST00000220411 491 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 AC154755.1-201ENSMUST00000225244 537 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Olfr1257-201ENSMUST00000060795 1016 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Gm23459-201ENSMUST00000083259 131 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Gm8246-202ENSMUST00000180788 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Gm44777-201ENSMUST00000205941 4052 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Parn-201ENSMUST00000058884 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Slu7-206ENSMUST00000178622 3566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Atf2-203ENSMUST00000100009 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Gm37717-201ENSMUST00000192647 3027 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Pln-206ENSMUST00000220197 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Gm9006-201ENSMUST00000165520 841 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Gm43470-201ENSMUST00000196175 454 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Gm43779-201ENSMUST00000196691 829 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Gm32754-201ENSMUST00000199442 257 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 AC136376.1-201ENSMUST00000228496 950 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Psg27-201ENSMUST00000094794 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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