Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Gm16523-202ENSMUST00000203640 4750 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Tmprss15-202ENSMUST00000060402 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Vmn2r97-201ENSMUST00000168710 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Usp26-202ENSMUST00000114869 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Usp26-201ENSMUST00000069509 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Akr1e1-202ENSMUST00000110691 3288 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Rapgef4-203ENSMUST00000102698 2982 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Plcb4-202ENSMUST00000110109 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 AC159244.3-201ENSMUST00000222887 3153 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Gm37531-201ENSMUST00000191628 5415 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Gm43363-201ENSMUST00000201590 2647 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Olfr508-201ENSMUST00000072914 1635 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Abcd2-201ENSMUST00000069511 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Mup3-202ENSMUST00000107472 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Mup3-203ENSMUST00000107488 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Gm8692-201ENSMUST00000118102 438 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Rpl5-ps1-201ENSMUST00000121367 894 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Fundc1-203ENSMUST00000142638 597 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Gm26211-201ENSMUST00000158578 129 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Gm25445-201ENSMUST00000158996 299 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Gm16164-201ENSMUST00000160078 468 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Rpl28-ps4-201ENSMUST00000170447 377 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Ighv5-19-201ENSMUST00000193466 297 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Gm34149-201ENSMUST00000203547 304 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Gm38590-201ENSMUST00000209515 970 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 AC123832.2-201ENSMUST00000215151 129 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 AC164618.3-201ENSMUST00000224863 681 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 S100g-201ENSMUST00000038769 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Gm15500-201ENSMUST00000071523 894 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Gm8401-201ENSMUST00000120248 1739 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Gm8878-201ENSMUST00000173552 1725 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Ctsm-201ENSMUST00000099451 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 AC153959.1-201ENSMUST00000213617 1694 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Gm45061-201ENSMUST00000204395 2095 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Gm32736-201ENSMUST00000200427 2701 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Gm10693-202ENSMUST00000205904 4007 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 AC155298.1-201ENSMUST00000225350 3250 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Robo2-210ENSMUST00000226478 8059 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Creb5-212ENSMUST00000205120 7482 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Vmn1r39-208ENSMUST00000228919 2105 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 AC154642.2-201ENSMUST00000223657 2485 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Nebl-213ENSMUST00000177966 1690 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Olfr488-202ENSMUST00000211508 4624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Olfr488-203ENSMUST00000215173 4605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Gm19368-201ENSMUST00000221258 4424 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Gm13890-201ENSMUST00000117578 390 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Gm15715-201ENSMUST00000118032 283 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Gm13469-201ENSMUST00000118231 350 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Gm14115-201ENSMUST00000119242 482 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Zfp783-203ENSMUST00000130463 537 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Gm22636-201ENSMUST00000158142 275 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Gm25013-201ENSMUST00000158402 128 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Gm22529-201ENSMUST00000158817 123 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Gm7745-201ENSMUST00000182235 973 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Gm28783-201ENSMUST00000188872 359 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Gm37770-201ENSMUST00000192855 772 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Gm45473-201ENSMUST00000211452 616 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 AC122371.2-201ENSMUST00000220583 366 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Gm5374-202ENSMUST00000222910 314 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Olfr447-201ENSMUST00000055763 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Sntn-201ENSMUST00000061045 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Fam183b-202ENSMUST00000094156 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 4930432M17Rik-201ENSMUST00000098646 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 CT009696.4-201ENSMUST00000213487 1801 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Akr1c20-201ENSMUST00000078239 1317 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Gm37951-201ENSMUST00000192963 3032 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Ccp110-201ENSMUST00000038650 4716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 BC055402-201ENSMUST00000190488 3301 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Actn1Q7TPR4 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms