Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm18879-201ENSMUST00000221187 1537 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 AC156025.2-201ENSMUST00000225907 1533 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Tmsb15b1-201ENSMUST00000113071 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Dnajc5b-202ENSMUST00000118735 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm11227-201ENSMUST00000119774 471 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps103-201ENSMUST00000120171 893 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm12104-201ENSMUST00000120359 979 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm11496-201ENSMUST00000128078 581 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm12629-201ENSMUST00000145751 711 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm22326-201ENSMUST00000158897 351 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm8919-201ENSMUST00000182028 1014 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm5430-201ENSMUST00000182525 915 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm27853-201ENSMUST00000184176 250 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm29175-201ENSMUST00000189500 402 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm37381-202ENSMUST00000194643 657 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm43033-201ENSMUST00000199682 425 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm5306-201ENSMUST00000203325 757 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm44134-202ENSMUST00000204777 545 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm34533-201ENSMUST00000209249 552 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm45875-201ENSMUST00000212178 781 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 AC166902.2-201ENSMUST00000215193 837 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm2398-201ENSMUST00000218347 883 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm30239-201ENSMUST00000220776 780 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm26861-206ENSMUST00000222633 1039 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 AC158750.1-201ENSMUST00000226163 634 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 AC133203.2-201ENSMUST00000226709 464 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm6104-201ENSMUST00000078030 603 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 B020031M17Rik-201ENSMUST00000080505 522 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Papola-215ENSMUST00000170002 2605 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Btbd35f21-201ENSMUST00000105017 1943 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Btbd35f27-201ENSMUST00000178143 1943 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Btbd35f2-201ENSMUST00000179991 1949 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Btbd35f16-201ENSMUST00000185755 1949 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Pkn2-206ENSMUST00000173830 2808 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 LOC102637012-201ENSMUST00000217248 2562 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Olfr770-202ENSMUST00000203887 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Olfr578-202ENSMUST00000215606 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Olfr9-201ENSMUST00000091996 2672 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1438-ps1-201ENSMUST00000208398 4761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm44209-201ENSMUST00000204556 4153 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Hspa9-ps1-201ENSMUST00000119602 1933 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1079-202ENSMUST00000111582 2141 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Ryr3-202ENSMUST00000091818 15410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Tmem45a2-201ENSMUST00000067173 3073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Zfp119b-202ENSMUST00000189452 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Cd200r3-205ENSMUST00000114613 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm8692-201ENSMUST00000118102 438 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm12099-201ENSMUST00000118660 750 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm15153-201ENSMUST00000119867 274 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Astx4d-201ENSMUST00000123136 1149 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Astx3-201ENSMUST00000123508 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm12243-201ENSMUST00000128521 821 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Platr27-201ENSMUST00000131365 629 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Olfr377-ps1-201ENSMUST00000134011 1136 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm23497-201ENSMUST00000157738 130 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm23822-201ENSMUST00000158739 128 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Snrpe-204ENSMUST00000166915 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps60-201ENSMUST00000173467 852 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm25640-201ENSMUST00000175378 125 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Astx4a-201ENSMUST00000177683 1149 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Astx1c-201ENSMUST00000177724 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm23018-201ENSMUST00000177928 109 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Astx4c-201ENSMUST00000178390 1149 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Astx1b-201ENSMUST00000178608 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Astx2-201ENSMUST00000179135 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Astx4b-201ENSMUST00000179359 1149 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Astx1a-201ENSMUST00000179529 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Astx5-201ENSMUST00000179723 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Astx6-201ENSMUST00000180281 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Snhg5-201ENSMUST00000180563 1004 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm4221-201ENSMUST00000181538 1232 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Mir7222-201ENSMUST00000183740 75 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1252-201ENSMUST00000186710 1099 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm29409-202ENSMUST00000189623 901 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Ighv3-2-201ENSMUST00000191842 349 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm34716-201ENSMUST00000194060 621 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm30353-202ENSMUST00000195486 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms