Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Gm32754-202ENSMUST00000199504 480 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm44969-201ENSMUST00000207829 549 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm29521-203ENSMUST00000216148 805 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm20368-201ENSMUST00000220716 301 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm7042-201ENSMUST00000223027 384 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 AC154417.1-201ENSMUST00000223876 476 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm42661-201ENSMUST00000202364 1442 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm42561-201ENSMUST00000202563 1442 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Btnl10-202ENSMUST00000069941 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Vmn2r80-201ENSMUST00000165834 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Vmn1r54-202ENSMUST00000226921 3234 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm13648-201ENSMUST00000138361 1536 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Ablim1-207ENSMUST00000111529 5927 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Myo15-201ENSMUST00000071880 11769 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Ctnnd1-203ENSMUST00000067232 6119 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Daw1-202ENSMUST00000065436 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Cers4-201ENSMUST00000008350 9475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Cdh23-203ENSMUST00000105462 10592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 AC116726.1-201ENSMUST00000215028 3497 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Itsn1-208ENSMUST00000114002 14012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm12488-201ENSMUST00000122449 499 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Smyd1-204ENSMUST00000129630 376 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm13062-201ENSMUST00000151337 562 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Tnik-211ENSMUST00000161964 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm17160-201ENSMUST00000170645 260 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Vmn1r-ps25-201ENSMUST00000173545 799 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Mir7685-201ENSMUST00000183555 62 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm28188-201ENSMUST00000190483 236 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm43078-201ENSMUST00000197222 168 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Olfr1135-201ENSMUST00000099853 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Pramel3-202ENSMUST00000118821 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Slc43a2-201ENSMUST00000042561 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Cltc-202ENSMUST00000103186 6519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Oprk1-203ENSMUST00000160339 2481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 9630028B13Rik-201ENSMUST00000143787 3406 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Pcdh15-226ENSMUST00000151116 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Galnt5-201ENSMUST00000112616 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 BC065397-203ENSMUST00000134066 3201 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Adgrg6-201ENSMUST00000041168 6507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Adgrl2-212ENSMUST00000198779 4592 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Arhgap12-202ENSMUST00000077128 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Ptprd-201ENSMUST00000050757 4698 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Zkscan8-201ENSMUST00000045228 8805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm37510-201ENSMUST00000194151 4762 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm13679-201ENSMUST00000118678 484 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm11825-201ENSMUST00000120710 736 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm11990-201ENSMUST00000121505 897 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Vmn1r-ps94-201ENSMUST00000122016 458 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm14330-201ENSMUST00000155455 455 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm15775-201ENSMUST00000159796 538 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Dnaja1-ps-201ENSMUST00000162103 642 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm8358-201ENSMUST00000167222 555 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm20674-201ENSMUST00000177452 369 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm19002-201ENSMUST00000192649 1012 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm37308-201ENSMUST00000194684 100 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 BC037156-201ENSMUST00000196993 430 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm7733-201ENSMUST00000199038 919 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Tbc1d24-213ENSMUST00000201805 3806 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm2762-204ENSMUST00000201815 537 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 4930591E09Rik-201ENSMUST00000215643 480 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 AC154436.2-201ENSMUST00000227408 208 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Olfr1026-201ENSMUST00000056718 965 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Mir342-201ENSMUST00000083502 99 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Alkbh8-202ENSMUST00000165105 2256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Tmprss11g-201ENSMUST00000134179 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Prpf4b-201ENSMUST00000077853 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Tbc1d24-206ENSMUST00000168410 7683 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Ehbp1-201ENSMUST00000045167 4821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Ccl9-201ENSMUST00000019266 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Ftx-205ENSMUST00000156211 4215 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 AC155255.1-201ENSMUST00000218751 1428 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Mpp7-201ENSMUST00000115869 4975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Cd84-203ENSMUST00000135386 3434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm13259-201ENSMUST00000120792 456 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm12655-202ENSMUST00000133884 925 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm12753-201ENSMUST00000152086 653 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Rps27-201ENSMUST00000170122 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Vmn2r-ps32-201ENSMUST00000175794 757 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Obox4-ps38-201ENSMUST00000175961 724 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Mrgprc1-ps-201ENSMUST00000185552 952 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm5554-201ENSMUST00000199726 1206 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 AC154484.2-201ENSMUST00000228359 818 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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