Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm11734-201ENSMUST00000132261 728 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 4933401B06Rik-201ENSMUST00000139758 1155 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm15503-201ENSMUST00000141541 449 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm16079-201ENSMUST00000149065 578 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm15511-201ENSMUST00000152570 557 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm25219-201ENSMUST00000157545 330 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm16132-201ENSMUST00000159296 598 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Ms4a2-202ENSMUST00000164792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm20480-201ENSMUST00000173953 250 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm5430-201ENSMUST00000182525 915 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm27240-201ENSMUST00000183616 677 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm28527-201ENSMUST00000185210 297 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm29592-201ENSMUST00000189434 370 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm37774-201ENSMUST00000194401 245 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm31887-201ENSMUST00000197661 501 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm29736-201ENSMUST00000198189 385 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm43233-201ENSMUST00000200491 616 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 1700013A02Rik-201ENSMUST00000202969 645 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm44091-201ENSMUST00000205212 649 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Camta1-213ENSMUST00000214673 243 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm5055-201ENSMUST00000215697 581 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm18103-201ENSMUST00000216621 779 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 AC126685.1-201ENSMUST00000221001 121 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 AC113031.1-201ENSMUST00000227400 432 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r50-201ENSMUST00000081706 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Serpinb6e-201ENSMUST00000110275 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Olfr204-202ENSMUST00000216261 5371 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Macf1-202ENSMUST00000084301 23398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Fam205c-201ENSMUST00000055944 1655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 AC163731.1-201ENSMUST00000225696 3118 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Samd12-201ENSMUST00000078673 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Brs3-201ENSMUST00000033464 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Cd200r3-206ENSMUST00000114622 1339 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Olfr1353-201ENSMUST00000039718 1992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Dcdc2c-204ENSMUST00000189735 1434 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Rnf24-201ENSMUST00000059372 5978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm18716-201ENSMUST00000204507 1603 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Olfr16-202ENSMUST00000215254 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 AC158779.2-201ENSMUST00000227902 1947 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Vmn2r42-201ENSMUST00000086282 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm25346-201ENSMUST00000104509 128 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 1700006E09Rik-201ENSMUST00000010985 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Myl2-202ENSMUST00000111750 729 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm11821-201ENSMUST00000117335 979 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm12307-201ENSMUST00000120581 590 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm12438-201ENSMUST00000122034 336 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm22518-201ENSMUST00000158267 68 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Obox6-ps1-201ENSMUST00000176658 1042 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm20643-201ENSMUST00000177284 322 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Mir6911-201ENSMUST00000184241 69 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm28918-201ENSMUST00000188822 699 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm43838-201ENSMUST00000196357 348 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm34078-201ENSMUST00000198202 744 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm36793-201ENSMUST00000199211 922 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm7492-201ENSMUST00000201745 725 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm44108-201ENSMUST00000203525 422 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 BC024386-204ENSMUST00000209842 688 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 AC159208.1-201ENSMUST00000221403 649 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 AC137871.3-201ENSMUST00000226628 225 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Sprr2k-201ENSMUST00000067102 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Olfr282-201ENSMUST00000075851 928 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Olfr149-201ENSMUST00000082027 1030 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Mtus1-203ENSMUST00000093534 4148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm10693-202ENSMUST00000205904 4007 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm43169-201ENSMUST00000199544 4734 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Cdh17-202ENSMUST00000108303 3287 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Ppig-202ENSMUST00000090858 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm9521-201ENSMUST00000206656 1516 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 AC155167.2-201ENSMUST00000226127 1945 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm42781-201ENSMUST00000201317 2719 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Adam21-201ENSMUST00000008582 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Nfatc3-206ENSMUST00000212742 3207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Tet1-206ENSMUST00000174189 14369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Enpp2-201ENSMUST00000041591 3095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm3608-201ENSMUST00000086725 2858 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Zpld1-201ENSMUST00000036412 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Hrnr-201ENSMUST00000090856 10656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Lpar6-201ENSMUST00000044405 5400 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Rad21l-201ENSMUST00000096439 1650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm28673-201ENSMUST00000186562 1498 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm37344-203ENSMUST00000195490 1498 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 AC132384.12-201ENSMUST00000219608 4227 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Trbv4-201ENSMUST00000103265 393 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Traj46-201ENSMUST00000103696 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm23311-201ENSMUST00000104152 134 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm12790-201ENSMUST00000106916 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Ncald-202ENSMUST00000116445 858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm22714-201ENSMUST00000116894 78 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms