Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Mup8-202ENSMUST00000163931 986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm17198-201ENSMUST00000171792 1154 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm9597-201ENSMUST00000171913 602 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps141-201ENSMUST00000176293 753 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Mir6971-201ENSMUST00000183497 63 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm38122-201ENSMUST00000192679 885 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm31887-201ENSMUST00000197661 501 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm43382-201ENSMUST00000198954 838 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm7048-201ENSMUST00000199395 1891 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm2225-201ENSMUST00000209570 377 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Olfr118-202ENSMUST00000215811 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 AC136376.1-201ENSMUST00000228496 950 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm5142-201ENSMUST00000066558 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Olfr1126-201ENSMUST00000071355 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Syt14-205ENSMUST00000215093 9274 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Dlx6os1-201ENSMUST00000159568 4608 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Hspa13-202ENSMUST00000114244 2674 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Npy2r-202ENSMUST00000098997 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm37186-201ENSMUST00000195629 2861 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm38124-201ENSMUST00000191710 2581 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Sis-202ENSMUST00000167334 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Olfr396-ps1-201ENSMUST00000143750 1675 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Cd274-201ENSMUST00000016640 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Apol10a-201ENSMUST00000060551 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 F13b-201ENSMUST00000027615 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Mef2c-214ENSMUST00000197722 3517 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm4991-201ENSMUST00000118899 1552 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Ggta1-203ENSMUST00000102794 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Mir700-201ENSMUST00000102169 79 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Lrrc51-205ENSMUST00000106965 743 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm13641-201ENSMUST00000117993 473 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm4342-201ENSMUST00000118982 367 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm13604-201ENSMUST00000119332 482 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm14900-201ENSMUST00000120304 733 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gstm2-201ENSMUST00000012348 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 1700047A11Rik-201ENSMUST00000144750 427 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Clec4a2-204ENSMUST00000161365 918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm16161-201ENSMUST00000162239 290 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Mup7-203ENSMUST00000166098 1033 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 S100a2-201ENSMUST00000179550 315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm26665-201ENSMUST00000181378 839 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 4933404I11Rik-201ENSMUST00000190294 1202 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Ighv1-27-201ENSMUST00000194473 340 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm42983-201ENSMUST00000199879 815 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm43893-201ENSMUST00000203362 437 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm44243-201ENSMUST00000204323 692 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm19653-201ENSMUST00000204326 1039 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm19033-201ENSMUST00000208516 964 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm10688-201ENSMUST00000214985 520 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 AC121788.1-201ENSMUST00000218514 1046 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 AC211878.6-201ENSMUST00000221896 358 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm5160-201ENSMUST00000069552 444 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Olfr1354-201ENSMUST00000075859 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Mup4-201ENSMUST00000075973 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Olfr826-201ENSMUST00000078322 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Rpl27a-ps2-201ENSMUST00000080234 450 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Fam183b-202ENSMUST00000094156 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Mup13-202ENSMUST00000098042 984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Olfr657-201ENSMUST00000098171 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Ercc6l-201ENSMUST00000056904 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Olfr1340-204ENSMUST00000217334 2001 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Lipn-201ENSMUST00000025682 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Nsun6-203ENSMUST00000114713 2420 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Olfr1500-207ENSMUST00000219674 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Olfr536-204ENSMUST00000215340 3938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Pcdh11x-203ENSMUST00000113364 4454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Dmxl1-201ENSMUST00000041772 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Hlcs-209ENSMUST00000228910 4150 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.2 ms