Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm12077-201ENSMUST00000117049 364 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Ttc39dQ0VF76 Gm14842-201ENSMUST00000119577 269 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
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Ttc39dQ0VF76 Gm15056-202ENSMUST00000167686 314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Ttc39dQ0VF76 Gm24103-201ENSMUST00000174930 77 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Ttc39dQ0VF76 Gm3500-202ENSMUST00000178058 609 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Ttc39dQ0VF76 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Ttc39dQ0VF76 Gm29592-201ENSMUST00000189434 370 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Ttc39dQ0VF76 Gm36840-201ENSMUST00000202688 250 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Ttc39dQ0VF76 Gm45008-201ENSMUST00000206420 493 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
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Ttc39dQ0VF76 Gm9088-201ENSMUST00000220237 508 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
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Ttc39dQ0VF76 AC164295.1-201ENSMUST00000224861 186 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
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Ttc39dQ0VF76 Nt5c3-202ENSMUST00000101367 1519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
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Ttc39dQ0VF76 Dclre1c-204ENSMUST00000115066 3828 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
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Ttc39dQ0VF76 Olfr334-ps1-201ENSMUST00000121252 892 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ttc39dQ0VF76 Gm5795-202ENSMUST00000166275 612 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
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Ttc39dQ0VF76 Gm18006-201ENSMUST00000177411 662 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ttc39dQ0VF76 Gm10413-202ENSMUST00000177913 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ttc39dQ0VF76 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ttc39dQ0VF76 Gm10338-202ENSMUST00000178623 612 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ttc39dQ0VF76 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ttc39dQ0VF76 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ttc39dQ0VF76 Krtdap-203ENSMUST00000187493 420 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ttc39dQ0VF76 Krtdap-205ENSMUST00000189673 345 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ttc39dQ0VF76 Krtdap-206ENSMUST00000189962 323 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms