Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gatad2b-203ENSMUST00000197988 1815 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm44000-201ENSMUST00000205038 1478 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Olfr259-203ENSMUST00000215828 4095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm22022-201ENSMUST00000104355 127 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Mir190b-201ENSMUST00000104803 80 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Armt1-202ENSMUST00000117489 680 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm13473-201ENSMUST00000119289 367 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm16056-201ENSMUST00000119293 135 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm14945-201ENSMUST00000119556 1118 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm11890-201ENSMUST00000119585 417 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm8430-201ENSMUST00000119780 471 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 4930548K13Rik-201ENSMUST00000154459 561 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm16143-201ENSMUST00000155982 538 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm16034-201ENSMUST00000156446 480 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Mir1962-201ENSMUST00000157516 121 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm26349-201ENSMUST00000157530 130 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm22555-201ENSMUST00000157801 62 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm16434-202ENSMUST00000177712 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm6676-202ENSMUST00000178376 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm29641-201ENSMUST00000188955 259 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm37349-201ENSMUST00000194205 624 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm7142-201ENSMUST00000194232 586 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 AC137678.1-201ENSMUST00000198370 118 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm43036-201ENSMUST00000200594 373 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm43198-201ENSMUST00000200927 326 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm18327-201ENSMUST00000202426 830 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm43973-201ENSMUST00000203562 210 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm9354-201ENSMUST00000209075 468 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm39363-201ENSMUST00000214251 723 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm32443-201ENSMUST00000217880 707 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 AC131720.1-201ENSMUST00000218629 2132 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm46234-201ENSMUST00000218702 259 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 AC167222.2-201ENSMUST00000220014 295 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 AC155927.1-201ENSMUST00000220114 1200 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 AC123061.2-201ENSMUST00000226234 802 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 AC101205.1-201ENSMUST00000227916 907 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 AC123665.3-201ENSMUST00000228735 1216 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gpihbp1-201ENSMUST00000023243 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Olfr648-201ENSMUST00000052659 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Arl9-201ENSMUST00000071199 402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Vpreb2-201ENSMUST00000075371 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Rps27a-ps2-201ENSMUST00000078766 467 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Dmrtc1c2-202ENSMUST00000087899 717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm10805-201ENSMUST00000099710 399 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Zfp712-201ENSMUST00000167565 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Zeb2-213ENSMUST00000176732 1762 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm44739-201ENSMUST00000205294 1426 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Stk38l-201ENSMUST00000001675 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Irgm1-202ENSMUST00000097271 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm15681-201ENSMUST00000137501 2704 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Cnga1-205ENSMUST00000201463 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm20706-201ENSMUST00000175985 2023 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm26530-201ENSMUST00000180969 3941 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Zkscan7-204ENSMUST00000214957 5650 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm44678-201ENSMUST00000207828 2775 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm12346-201ENSMUST00000121455 2255 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm7265-201ENSMUST00000192735 3502 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Rabgap1l-202ENSMUST00000028052 6338 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm5127-201ENSMUST00000101296 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Slco6b1-202ENSMUST00000178359 1778 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm9938-201ENSMUST00000067077 1756 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Dnah10-203ENSMUST00000141137 13862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Cyp4a31-201ENSMUST00000030480 2396 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Olfr1342-202ENSMUST00000216226 3269 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Ighv5-9-1-201ENSMUST00000103452 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Ighv1-84-201ENSMUST00000103551 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm6592-201ENSMUST00000115563 507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm7785-201ENSMUST00000117121 892 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Ccnb2-ps-201ENSMUST00000118290 623 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm13006-201ENSMUST00000118683 214 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm13902-201ENSMUST00000120168 605 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm15049-201ENSMUST00000120474 463 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm15079-201ENSMUST00000121943 216 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm25178-201ENSMUST00000122633 325 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm14155-201ENSMUST00000127230 587 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Prkag2os1-201ENSMUST00000134633 991 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Olfr1177-ps-201ENSMUST00000137895 921 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 4932414J04Rik-201ENSMUST00000152483 3059 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm26408-201ENSMUST00000157672 127 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm16161-201ENSMUST00000162239 290 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm10662-201ENSMUST00000168053 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Vmn2r-ps60-201ENSMUST00000173296 897 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Znrd1as-203ENSMUST00000173814 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.7 ms