Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Mndal-204ENSMUST00000188804 2026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Gm36888-201ENSMUST00000195819 2945 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Gm15366-201ENSMUST00000118433 1019 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Spink8-201ENSMUST00000118732 637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Gm15967-201ENSMUST00000120027 1116 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Gm13338-201ENSMUST00000120235 361 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Gm12096-201ENSMUST00000121149 829 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Gm11925-201ENSMUST00000121375 535 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Gm13380-201ENSMUST00000124322 718 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrprbP47758 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Lrrc75aos1-201ENSMUST00000142492 779 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Gm14747-201ENSMUST00000149888 984 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Gm24359-201ENSMUST00000158418 221 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SrprbP47758 G930045G22Rik-202ENSMUST00000161723 673 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Vmn1r-ps141-201ENSMUST00000176293 753 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Gm29191-201ENSMUST00000185427 621 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Gm29426-202ENSMUST00000186564 536 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Gm28486-201ENSMUST00000188443 621 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Ighv5-5-201ENSMUST00000193826 329 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Gm34716-201ENSMUST00000194060 621 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Gm18382-201ENSMUST00000194394 582 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Gm42916-201ENSMUST00000197142 1042 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Gm33050-201ENSMUST00000198132 501 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Gm42504-201ENSMUST00000198312 525 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Gm9023-201ENSMUST00000198408 1038 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Gm43849-201ENSMUST00000201086 215 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SrprbP47758 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Tas2r142-ps5-201ENSMUST00000204651 929 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Gm45127-201ENSMUST00000205984 1015 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Gm44984-201ENSMUST00000207802 394 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Gm45272-202ENSMUST00000209875 502 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrprbP47758 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Gm30933-201ENSMUST00000217174 381 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrprbP47758 AC153567.1-201ENSMUST00000218424 1263 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Gm38560-201ENSMUST00000220169 646 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrprbP47758 AC126673.2-201ENSMUST00000221052 686 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SrprbP47758 CT010505.1-201ENSMUST00000227026 396 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SrprbP47758 AC139197.1-201ENSMUST00000228332 813 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Cypt1-201ENSMUST00000024026 672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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SrprbP47758 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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SrprbP47758 Adgb-204ENSMUST00000172530 5215 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Golga1-202ENSMUST00000112850 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Olfr734-203ENSMUST00000217152 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Vmn1r15-201ENSMUST00000228297 2021 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Sirpb1c-204ENSMUST00000108352 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Vmn1r37-203ENSMUST00000226886 1308 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Xpo1-203ENSMUST00000102870 3471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Dennd2c-202ENSMUST00000172288 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Tmod2-206ENSMUST00000215036 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrprbP47758 E030032P16Rik-201ENSMUST00000198813 2931 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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SrprbP47758 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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SrprbP47758 2610021A01Rik-201ENSMUST00000163475 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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SrprbP47758 Dbi-202ENSMUST00000112648 504 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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SrprbP47758 Gm15164-201ENSMUST00000122203 271 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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SrprbP47758 Gm12148-201ENSMUST00000153791 292 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Mir1953-201ENSMUST00000157866 89 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Vmn1r-ps67-201ENSMUST00000173843 691 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Gm22254-201ENSMUST00000179186 110 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Gm29594-201ENSMUST00000191181 398 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Gm19231-201ENSMUST00000193212 830 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Gm42708-201ENSMUST00000196332 905 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Gm42509-201ENSMUST00000197390 781 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Gm43157-201ENSMUST00000198223 412 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Gm44128-201ENSMUST00000204909 219 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Fxyd1-212ENSMUST00000206305 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrprbP47758 Cers3-202ENSMUST00000208521 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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