Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 AL807824.1-201ENSMUST00000223151 183 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm24029-201ENSMUST00000083928 143 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Sv2c-201ENSMUST00000161263 9101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Akt3-203ENSMUST00000111160 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Gm15107-201ENSMUST00000112796 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Ott-201ENSMUST00000177554 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Ott-202ENSMUST00000177606 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Gm15085-201ENSMUST00000178169 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Ott-203ENSMUST00000179348 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Zmat4-206ENSMUST00000207301 4207 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Bcorl1-201ENSMUST00000037596 7360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprkP35822 AC110043.1-201ENSMUST00000220278 1627 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprkP35822 C030015A19Rik-201ENSMUST00000203368 2551 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Gm5844-201ENSMUST00000119417 2191 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Cfap70-201ENSMUST00000022348 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Slc17a6-201ENSMUST00000032710 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Gm45493-201ENSMUST00000209494 3948 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Zfp788-203ENSMUST00000100275 3177 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprkP35822 9630028B13Rik-201ENSMUST00000143787 3406 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Fbxo7-204ENSMUST00000130320 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Gm20545-201ENSMUST00000174739 210 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Gm498-203ENSMUST00000179036 990 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Gm8826-201ENSMUST00000193161 948 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Olfr1026-201ENSMUST00000056718 965 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Gm10064-201ENSMUST00000071235 399 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Rpl38-201ENSMUST00000077915 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Olfr599-201ENSMUST00000098201 1050 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Lrrc31-201ENSMUST00000108263 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Gm30340-201ENSMUST00000191898 2198 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Dock2-202ENSMUST00000101364 1616 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Gm37347-201ENSMUST00000193969 3071 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Vmn1r181-208ENSMUST00000228842 4491 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprkP35822 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Heatr5a-201ENSMUST00000040583 7763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Scn11a-201ENSMUST00000070617 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Gm17473-201ENSMUST00000180585 2216 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Gm22499-201ENSMUST00000104501 135 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Gm12115-201ENSMUST00000119969 447 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Gm12074-201ENSMUST00000120189 219 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Gm15335-201ENSMUST00000122442 411 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Gm17102-201ENSMUST00000170929 906 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Ctla2b-202ENSMUST00000171347 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Vmn1r-ps80-201ENSMUST00000174838 966 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Mrgprc1-ps-201ENSMUST00000185552 952 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Gm6145-203ENSMUST00000210557 835 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Gm31432-201ENSMUST00000214727 538 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprkP35822 AC108846.2-201ENSMUST00000214925 731 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprkP35822 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprkP35822 CT030124.1-201ENSMUST00000217130 235 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Ctla2b-201ENSMUST00000021884 842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Gm20368-201ENSMUST00000220716 301 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprkP35822 n-R5s85-201ENSMUST00000083453 113 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Fbxo16-204ENSMUST00000226005 3700 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Plek-201ENSMUST00000020321 3896 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Gm10767-201ENSMUST00000099412 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Enpp2-202ENSMUST00000167541 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Olfr1392-206ENSMUST00000215861 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Usp25-201ENSMUST00000023580 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Gm36981-201ENSMUST00000192340 4485 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Gm37216-201ENSMUST00000193817 3478 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprkP35822 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Ppp1r1c-202ENSMUST00000090760 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Bmpr1b-204ENSMUST00000106232 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Tnfrsf22-201ENSMUST00000075588 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Gm43769-201ENSMUST00000201871 4323 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Gm3636-201ENSMUST00000100904 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Gm3173-201ENSMUST00000112776 519 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Gm11550-201ENSMUST00000118210 699 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Gm12488-201ENSMUST00000122449 499 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Smyd1-204ENSMUST00000129630 376 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Gm13274-202ENSMUST00000137624 271 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Gm23513-201ENSMUST00000158181 133 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Gm3173-202ENSMUST00000164603 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Gm3488-201ENSMUST00000178220 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Gm28507-201ENSMUST00000189737 703 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Gm5554-201ENSMUST00000199726 1206 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Gm43522-202ENSMUST00000200185 442 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Gm7181-201ENSMUST00000202197 434 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Api5-ps-201ENSMUST00000206607 577 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Gm31698-202ENSMUST00000214385 527 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprkP35822 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprkP35822 AC164437.5-201ENSMUST00000227235 4414 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Cntn5-202ENSMUST00000160216 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Svil-210ENSMUST00000140448 7423 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
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