Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RxraP28700 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RxraP28700 Ighv1-73-201ENSMUST00000197435 352 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm18747-201ENSMUST00000198129 648 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm44225-201ENSMUST00000203582 186 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm44020-201ENSMUST00000204618 664 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm35453-201ENSMUST00000210304 331 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RxraP28700 Nfatc3-206ENSMUST00000212742 3207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm18329-201ENSMUST00000215832 589 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RxraP28700 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm9535-201ENSMUST00000218499 768 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RxraP28700 AC167222.2-201ENSMUST00000220014 295 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RxraP28700 AC114008.1-201ENSMUST00000226193 937 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RxraP28700 Xpo7-203ENSMUST00000226448 3663 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RxraP28700 AC157572.1-201ENSMUST00000227187 825 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RxraP28700 AC123665.3-201ENSMUST00000228735 1216 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RxraP28700 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RxraP28700 Tas2r105-201ENSMUST00000053652 964 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RxraP28700 Olfr177-201ENSMUST00000072853 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm24695-201ENSMUST00000083877 83 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RxraP28700 Fstl5-203ENSMUST00000160261 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm37186-201ENSMUST00000195629 2861 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RxraP28700 Olfr491-203ENSMUST00000214605 2136 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RxraP28700 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm43891-201ENSMUST00000205132 3112 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RxraP28700 Sh3kbp1-202ENSMUST00000080394 2980 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm10603-202ENSMUST00000184420 4520 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RxraP28700 Dlg2-204ENSMUST00000107196 7490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Olfr535-204ENSMUST00000214296 5120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Il7r-201ENSMUST00000003981 3540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm2245-201ENSMUST00000160698 3376 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Arhgef9-203ENSMUST00000113878 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm43258-201ENSMUST00000200312 1950 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Rab30-203ENSMUST00000107180 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Rd3l-203ENSMUST00000189759 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Ikzf2-201ENSMUST00000027146 9278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Olfr448-203ENSMUST00000214529 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Pja2-201ENSMUST00000024888 4531 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Olfr26-201ENSMUST00000104874 931 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Chchd7-204ENSMUST00000119403 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm11866-201ENSMUST00000120209 335 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Olfr1069-ps1-201ENSMUST00000120755 965 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Rps12-ps1-201ENSMUST00000121980 401 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Olfr75-ps1-201ENSMUST00000135477 938 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm14507-201ENSMUST00000156169 347 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm23467-201ENSMUST00000157127 159 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm24359-201ENSMUST00000158418 221 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm18808-201ENSMUST00000173316 462 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm4831-201ENSMUST00000174626 594 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm22642-201ENSMUST00000175352 252 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm26595-201ENSMUST00000181585 484 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm29082-201ENSMUST00000185207 448 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm29060-201ENSMUST00000185339 457 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm28664-201ENSMUST00000186118 457 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm28817-201ENSMUST00000187598 830 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm29464-201ENSMUST00000187692 513 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm29209-201ENSMUST00000188176 457 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm29090-201ENSMUST00000188526 457 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm7804-202ENSMUST00000194187 854 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm37173-201ENSMUST00000194498 1017 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm37477-201ENSMUST00000195215 884 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 AC122844.1-201ENSMUST00000195971 107 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm3321-201ENSMUST00000200603 1129 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm43786-202ENSMUST00000202157 616 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm44097-201ENSMUST00000204112 563 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm44279-201ENSMUST00000205154 472 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Olfr1092-ps1-201ENSMUST00000216544 398 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Ppp1r36-204ENSMUST00000220187 504 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Zp4-ps-202ENSMUST00000222293 922 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm33312-201ENSMUST00000222443 332 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 AC167013.4-201ENSMUST00000226712 317 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 AC136376.1-201ENSMUST00000228496 950 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Ninj2-201ENSMUST00000035244 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Klre1-201ENSMUST00000053708 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Olfr19-201ENSMUST00000057886 1142 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm29486-201ENSMUST00000088648 372 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Zfp850-202ENSMUST00000180024 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Plekhg1-201ENSMUST00000042438 7190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Naip2-203ENSMUST00000167986 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm42881-201ENSMUST00000198636 3344 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Azin1-201ENSMUST00000065308 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Pramel4-203ENSMUST00000094520 2297 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Mtus1-205ENSMUST00000118835 6426 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Ceacam1-201ENSMUST00000098666 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Stk38l-201ENSMUST00000001675 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Mpp5-201ENSMUST00000082024 5470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RxraP28700 Tbx22-204ENSMUST00000168403 1715 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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