Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm44112-201ENSMUST00000204787 372 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 Gm43922-201ENSMUST00000205071 328 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 Gm44277-201ENSMUST00000205128 649 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 Gm6681-201ENSMUST00000205215 607 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 Gm33501-201ENSMUST00000209257 1193 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 Ccl7-201ENSMUST00000021011 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 Gm35021-202ENSMUST00000210289 961 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 Gm45628-201ENSMUST00000210849 274 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 Olfr878-202ENSMUST00000212878 1064 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 Gm9869-202ENSMUST00000214999 679 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 2010107E04Rik-201ENSMUST00000021719 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 Ctla2b-201ENSMUST00000021884 842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 AC127242.3-201ENSMUST00000222009 580 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 AC165157.1-201ENSMUST00000222981 580 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 4930474N09Rik-201ENSMUST00000223511 1176 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 AC141425.1-201ENSMUST00000224989 265 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 AC106830.2-201ENSMUST00000226624 943 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 AC135292.2-201ENSMUST00000227559 367 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 AC132833.4-201ENSMUST00000228313 203 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 AC136376.1-201ENSMUST00000228496 950 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 Apcs-201ENSMUST00000027824 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 Lcn4-201ENSMUST00000028283 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 Olfr350-201ENSMUST00000055130 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 9830144P21Rik-202ENSMUST00000127525 3362 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 AC123705.3-201ENSMUST00000223531 2069 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 Zzz3-210ENSMUST00000200570 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 Zfp955b-201ENSMUST00000099414 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 Yae1d1-201ENSMUST00000099735 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 Gm4064-201ENSMUST00000187482 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 Rnf213-202ENSMUST00000131035 16716 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 Gm29761-201ENSMUST00000215964 1939 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 Serpinb5-203ENSMUST00000112730 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 Kat6b-ps1-201ENSMUST00000187624 3433 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 Cpne4-202ENSMUST00000077190 3409 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
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Vpreb1P13372 Far2-202ENSMUST00000111607 3395 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 Gm28173-201ENSMUST00000191190 1496 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 Olfr1085-203ENSMUST00000214566 5129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 Gm14643-201ENSMUST00000144412 1848 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
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Vpreb1P13372 AC116797.1-201ENSMUST00000223988 3955 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
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Vpreb1P13372 Olfr586-202ENSMUST00000211075 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
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Vpreb1P13372 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 Rapgef4-203ENSMUST00000102698 2982 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 Vmn1r44-205ENSMUST00000226345 1965 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 Rabgap1-203ENSMUST00000112920 4847 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 Vmn1r213-202ENSMUST00000227573 3515 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
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Vpreb1P13372 Olfr260-ps1-201ENSMUST00000117279 822 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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Vpreb1P13372 1500004A13Rik-207ENSMUST00000184640 610 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
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Vpreb1P13372 Gm18875-201ENSMUST00000188563 882 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 Gm29214-201ENSMUST00000190216 570 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 Gm38291-201ENSMUST00000193671 259 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 Gm7270-201ENSMUST00000195818 1128 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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Vpreb1P13372 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 Gm8454-201ENSMUST00000196980 811 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 Gm44147-201ENSMUST00000204658 94 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 2200002A13Rik-201ENSMUST00000206633 709 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 1700034P13Rik-206ENSMUST00000207445 1146 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 Gm45157-201ENSMUST00000208729 401 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 Olfr931-ps1-201ENSMUST00000214941 549 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 Smim15-204ENSMUST00000224390 645 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Vpreb1P13372 AC116319.2-201ENSMUST00000228159 984 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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