Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Gm15075-201ENSMUST00000122187 477 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Gm2343-201ENSMUST00000161177 1042 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Gm25690-201ENSMUST00000175439 77 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Vmn2r-ps18-201ENSMUST00000177972 380 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Mup-ps7-201ENSMUST00000178292 545 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Mup-ps8-201ENSMUST00000178663 545 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Mup-ps9-201ENSMUST00000178847 545 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Mup-ps6-201ENSMUST00000179564 545 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 9330159M07Rik-203ENSMUST00000181448 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Gm27803-201ENSMUST00000183763 119 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Mrgprc4-ps-201ENSMUST00000186018 964 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Gm29105-201ENSMUST00000187256 450 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Gm43617-201ENSMUST00000196418 606 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Gm42621-201ENSMUST00000198114 275 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Gm18327-201ENSMUST00000202426 830 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Gm19252-201ENSMUST00000204705 305 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Gm45216-201ENSMUST00000205547 600 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Olfr162-ps1-201ENSMUST00000206015 934 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Gm5322-201ENSMUST00000206142 699 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Gm35520-201ENSMUST00000209235 784 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Gm36243-201ENSMUST00000211546 610 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Olfr941-ps1-201ENSMUST00000215258 935 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Ifngas1-201ENSMUST00000220034 1121 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 AC138718.1-201ENSMUST00000225947 1009 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 AC160120.1-201ENSMUST00000227446 663 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Il17f-201ENSMUST00000039046 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 1700014D04Rik-201ENSMUST00000055343 795 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Gm7887-201ENSMUST00000056948 537 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Olfr347-201ENSMUST00000078761 943 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Gm24763-201ENSMUST00000083688 190 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Ssxb3-202ENSMUST00000089379 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Ppp2r3c-201ENSMUST00000021410 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Tktl1-201ENSMUST00000010127 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Pik3r4-201ENSMUST00000065778 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Pnma2-202ENSMUST00000122431 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Ash1l-202ENSMUST00000186583 11644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Srp54a-201ENSMUST00000021407 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Cpne8-202ENSMUST00000064391 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Ndrg3-202ENSMUST00000072298 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Gm38236-201ENSMUST00000192661 3229 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Gpr22-203ENSMUST00000176710 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Phc2-203ENSMUST00000106080 3885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 AC160562.1-201ENSMUST00000216170 3468 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Synj2bp-204ENSMUST00000164431 3305 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Tnfrsf19-202ENSMUST00000111236 3958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Crtam-201ENSMUST00000034519 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Plscr2-201ENSMUST00000034932 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Mef2c-222ENSMUST00000199019 4441 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Gm17575-201ENSMUST00000180437 1991 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Olfr1353-201ENSMUST00000039718 1992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Mrpl17-202ENSMUST00000124482 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Gpm6b-203ENSMUST00000112224 4644 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Csf3r-202ENSMUST00000106162 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Ankrd45-202ENSMUST00000111608 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Tmem63c-201ENSMUST00000110187 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Pvt1-202ENSMUST00000181416 3319 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Gpatch2-206ENSMUST00000160471 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Dnmbp-203ENSMUST00000212048 4186 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Gm26785-201ENSMUST00000181775 2914 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Aoah-201ENSMUST00000021757 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Gm36737-201ENSMUST00000209653 2189 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Pdzd9-201ENSMUST00000033178 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Olfr935-202ENSMUST00000214157 1693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Arhgef9-209ENSMUST00000181987 6222 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 A430072C10Rik-201ENSMUST00000197848 2532 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Gm15128-201ENSMUST00000112814 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Fgf1-201ENSMUST00000040647 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Gm45562-201ENSMUST00000210015 1537 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Gm11408-201ENSMUST00000117889 519 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Gm13229-201ENSMUST00000118238 340 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Gm14159-201ENSMUST00000119832 451 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Gm11371-201ENSMUST00000120294 385 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Olfr1169-ps1-201ENSMUST00000121437 233 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Vmn1r-ps116-201ENSMUST00000121544 292 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Gm14223-201ENSMUST00000146060 517 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 4930551L18Rik-201ENSMUST00000156086 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Gm24729-201ENSMUST00000158225 137 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Gm25363-201ENSMUST00000158850 245 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Gm20713-201ENSMUST00000176344 435 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Gm22951-201ENSMUST00000179471 107 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Mir8120-201ENSMUST00000185035 139 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Gm28580-201ENSMUST00000186767 88 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 1810041H14Rik-203ENSMUST00000187773 416 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Gm8539-201ENSMUST00000199822 501 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Tprkb-214ENSMUST00000202803 716 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Gm45045-201ENSMUST00000207368 218 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Gm8748-201ENSMUST00000211125 587 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Gm3428-204ENSMUST00000214488 1020 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Gm9118-201ENSMUST00000219246 754 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 AC120540.1-201ENSMUST00000221879 324 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 AC069562.1-201ENSMUST00000224206 434 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SrfQ9JM73 Olfr131-201ENSMUST00000059560 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms