Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Gm28259-201ENSMUST00000190319 1497 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm28318-203ENSMUST00000190347 1499 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm28633-202ENSMUST00000190867 1485 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm29182-202ENSMUST00000191008 1499 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm28632-202ENSMUST00000191193 1499 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm28245-203ENSMUST00000191551 1495 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm38370-201ENSMUST00000192545 1499 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm37462-201ENSMUST00000193386 1498 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm32114-203ENSMUST00000195759 1499 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Fkbp15-202ENSMUST00000084528 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm8878-201ENSMUST00000173552 1725 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm9968-201ENSMUST00000147504 2990 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Celf2-204ENSMUST00000114924 8738 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Olfr845-202ENSMUST00000213344 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm19272-201ENSMUST00000184133 1753 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm8750-201ENSMUST00000173278 1537 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Mir700-201ENSMUST00000102169 79 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm23739-201ENSMUST00000102295 108 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 1700047A11Rik-201ENSMUST00000144750 427 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Bloc1s6os-201ENSMUST00000150154 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm23896-201ENSMUST00000158109 130 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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Atg4aQ8C9S8 4930519H02Rik-202ENSMUST00000198907 968 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Atg4aQ8C9S8 Gm6990-201ENSMUST00000086830 348 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 1500004A13Rik-203ENSMUST00000183966 3743 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 2610044O15Rik8-202ENSMUST00000186619 2337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Atg4aQ8C9S8 Gm37735-201ENSMUST00000193995 1406 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm5949-201ENSMUST00000213468 1421 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 AC155255.1-201ENSMUST00000218751 1428 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gabra6-203ENSMUST00000155218 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Cfap74-203ENSMUST00000105619 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Rnf145-202ENSMUST00000101327 4214 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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Atg4aQ8C9S8 Scoc-201ENSMUST00000081506 1791 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Map7d3-201ENSMUST00000114766 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Apol10a-201ENSMUST00000060551 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Atg4aQ8C9S8 Brs3-201ENSMUST00000033464 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Atg4aQ8C9S8 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Atg4aQ8C9S8 Olfr1181-201ENSMUST00000099823 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Olfr553-202ENSMUST00000216776 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 AC144733.2-201ENSMUST00000222552 2292 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm43961-201ENSMUST00000203289 1872 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Actrt1-201ENSMUST00000059466 1339 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm17473-201ENSMUST00000180585 2216 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm45001-201ENSMUST00000208279 2515 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm17056-201ENSMUST00000164804 2299 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm7155-201ENSMUST00000121143 1671 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Iqub-201ENSMUST00000052277 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Cep112it-201ENSMUST00000143781 4813 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Virma-203ENSMUST00000108307 6571 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm21093-201ENSMUST00000084677 1710 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm37435-201ENSMUST00000192078 3947 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Slc10a5-201ENSMUST00000078748 3923 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Dcdc2c-204ENSMUST00000189735 1434 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 AC154576.1-202ENSMUST00000223966 3320 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
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