Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Olfr1132-201ENSMUST00000090711 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Dnajc15-202ENSMUST00000226459 6193 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm10256-201ENSMUST00000179404 1358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm28583-201ENSMUST00000188903 2141 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Tnik-211ENSMUST00000161964 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Zfhx3-204ENSMUST00000220518 17152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Ipcef1-203ENSMUST00000105617 6041 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 AC164437.5-201ENSMUST00000227235 4414 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Pcdh15-234ENSMUST00000191854 9104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm37114-201ENSMUST00000195065 1804 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 2500004C02Rik-202ENSMUST00000128026 1898 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Cxcr6-202ENSMUST00000216072 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 AC138221.1-201ENSMUST00000216180 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Ctage5-223ENSMUST00000219140 4194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Ugt3a1-201ENSMUST00000022861 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm43627-201ENSMUST00000197119 2299 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Myof-201ENSMUST00000041475 6902 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm43027-201ENSMUST00000202906 3691 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 4930444P10Rik-201ENSMUST00000115367 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm8595-201ENSMUST00000118250 630 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Lgals8-208ENSMUST00000144283 1148 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm23224-201ENSMUST00000158122 271 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Vmn1r91-201ENSMUST00000165330 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps72-201ENSMUST00000172586 907 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Rian-203ENSMUST00000181527 989 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Mir6905-201ENSMUST00000184228 70 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm28179-202ENSMUST00000189029 327 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm28532-201ENSMUST00000190408 572 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 AC167222.2-201ENSMUST00000220014 295 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Smim15-202ENSMUST00000223808 808 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm24200-201ENSMUST00000082955 157 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Olfr457-202ENSMUST00000203396 4404 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm5431-203ENSMUST00000109212 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm37570-201ENSMUST00000195411 3106 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Zfp663-201ENSMUST00000073062 3157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Muc5b-201ENSMUST00000165147 14964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Glrp1-201ENSMUST00000067625 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Ints2-201ENSMUST00000018212 5906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm38198-201ENSMUST00000191772 3581 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Trmt10a-206ENSMUST00000162864 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Ripor2-204ENSMUST00000110383 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Pifo-201ENSMUST00000010280 956 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm5725-201ENSMUST00000105195 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Zmynd11-205ENSMUST00000110636 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm14871-201ENSMUST00000119056 194 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm6744-201ENSMUST00000119303 543 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm14330-201ENSMUST00000155455 455 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Prkg2-205ENSMUST00000162619 1308 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Vmn1r129-201ENSMUST00000165961 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm8720-201ENSMUST00000168392 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm28429-201ENSMUST00000188521 363 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm42568-201ENSMUST00000195639 1841 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm29755-201ENSMUST00000196976 948 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 4930533N22Rik-202ENSMUST00000206684 1503 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 AC115289.2-201ENSMUST00000223836 2803 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 AC129537.1-201ENSMUST00000226596 1228 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Phlpp2-201ENSMUST00000034175 7839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Ppp1r1c-202ENSMUST00000090760 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Uevld-201ENSMUST00000094398 4616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Dnm3os-201ENSMUST00000139662 7928 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Ccdc141-202ENSMUST00000049544 8969 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 AC122357.3-201ENSMUST00000221260 2293 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Vmn1r26-202ENSMUST00000228040 4546 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Ddx6-201ENSMUST00000170489 6065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm15354-201ENSMUST00000132019 1772 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Scoc-201ENSMUST00000081506 1791 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Olfr110-202ENSMUST00000216472 1721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Frem3-201ENSMUST00000039695 6384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm17791-201ENSMUST00000185660 1501 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Grik1-210ENSMUST00000228034 2708 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm22952-201ENSMUST00000116720 120 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Nlk-ps1-201ENSMUST00000120843 1230 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm13389-201ENSMUST00000142774 639 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm23631-201ENSMUST00000175291 123 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm29045-201ENSMUST00000187278 698 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Alox5ap-203ENSMUST00000200928 356 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm5306-201ENSMUST00000203325 757 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 CR974592.1-201ENSMUST00000220422 574 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
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