Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Nsd2-205ENSMUST00000114399 7786 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Olfr694-203ENSMUST00000216118 5035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Lingo2-201ENSMUST00000065173 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Gm10826-201ENSMUST00000215366 3304 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Zfp317-203ENSMUST00000213725 2354 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Add3-201ENSMUST00000025999 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Gm34777-201ENSMUST00000219688 2505 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Tbc1d24-213ENSMUST00000201805 3806 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Phyhipl-206ENSMUST00000162251 1540 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Kat7-202ENSMUST00000092766 3414 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Gm13881-201ENSMUST00000149025 3716 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Lingo2-202ENSMUST00000098151 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Vmn1r86-204ENSMUST00000227700 5487 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Samt2-201ENSMUST00000101137 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Gm24434-201ENSMUST00000104081 132 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Gm12790-201ENSMUST00000106916 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Gm11624-201ENSMUST00000118579 1041 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Gm16074-201ENSMUST00000119524 444 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Gm12618-201ENSMUST00000121754 483 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Gm12518-201ENSMUST00000122075 779 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Gm25102-201ENSMUST00000122479 112 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Gm24687-201ENSMUST00000157758 241 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Gm17164-201ENSMUST00000169013 506 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Gm22655-201ENSMUST00000174949 96 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Gm15257-201ENSMUST00000177680 883 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Gm15252-201ENSMUST00000177750 883 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Gm15256-201ENSMUST00000177793 883 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Gm15260-201ENSMUST00000179402 883 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Gm20915-201ENSMUST00000191575 663 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Gm18984-201ENSMUST00000193998 1124 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 D3Ertd751e-212ENSMUST00000194346 744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Gm5306-201ENSMUST00000203325 757 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Gm44312-201ENSMUST00000203536 469 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Gm7570-201ENSMUST00000215246 698 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Gm4928-201ENSMUST00000219622 850 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Gm17728-201ENSMUST00000076982 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Olfr594-201ENSMUST00000098205 1087 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Olfr548-ps1-201ENSMUST00000098228 933 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Gm37864-201ENSMUST00000195308 3075 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Ppargc1a-203ENSMUST00000132734 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Ceacam1-203ENSMUST00000098669 2873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Gm20768-201ENSMUST00000199527 2338 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Cts3-201ENSMUST00000054702 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Gm30122-202ENSMUST00000218662 1556 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Tmprss15-201ENSMUST00000023566 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Gm29824-201ENSMUST00000213183 3285 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Gm44039-201ENSMUST00000204192 2246 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Gm12388-201ENSMUST00000119112 1887 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Zfp773-202ENSMUST00000211240 4073 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Gm17137-201ENSMUST00000164106 4371 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 4930404I05Rik-201ENSMUST00000125902 2675 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Gm44897-201ENSMUST00000206187 1341 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Gm9602-201ENSMUST00000163325 2062 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Gm8356-201ENSMUST00000163636 2062 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Mir290a-201ENSMUST00000104627 83 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Gm11821-201ENSMUST00000117335 979 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Gm14836-201ENSMUST00000118567 471 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Gm13818-201ENSMUST00000119441 511 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Gm12244-201ENSMUST00000119500 291 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Gm24733-201ENSMUST00000158863 253 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Gm24179-201ENSMUST00000158925 127 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Gm16269-201ENSMUST00000160532 409 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 BC050972-202ENSMUST00000169153 467 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Vmn2r-ps73-201ENSMUST00000173890 1194 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Gm28934-201ENSMUST00000186491 346 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Gm29519-201ENSMUST00000186994 398 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 1700074H08Rik-201ENSMUST00000189831 555 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Gm20052-204ENSMUST00000202443 648 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Gm45485-201ENSMUST00000211229 357 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxa13Q62424 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 288.5 ms