Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Hmgn3-205ENSMUST00000187193 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm28473-201ENSMUST00000187325 696 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm28682-201ENSMUST00000187430 696 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm28738-201ENSMUST00000187480 696 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm28949-201ENSMUST00000187805 696 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm28773-201ENSMUST00000187925 696 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm29319-201ENSMUST00000188060 696 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm29422-201ENSMUST00000188062 694 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm28787-201ENSMUST00000188357 696 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm29312-201ENSMUST00000188724 696 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Als2cr12-203ENSMUST00000188772 1382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm29451-201ENSMUST00000188862 696 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm29637-201ENSMUST00000188877 696 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm29033-201ENSMUST00000189114 696 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm29614-201ENSMUST00000189263 694 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm28751-201ENSMUST00000189287 696 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm29559-201ENSMUST00000189412 696 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm28272-201ENSMUST00000189512 696 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm28483-201ENSMUST00000189519 696 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm28123-201ENSMUST00000189725 696 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm28368-201ENSMUST00000189804 696 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm29119-201ENSMUST00000189973 696 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm28716-201ENSMUST00000190217 696 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm29239-201ENSMUST00000190304 696 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm28837-201ENSMUST00000190397 696 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm28531-201ENSMUST00000190529 696 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm28165-201ENSMUST00000190669 694 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm29181-201ENSMUST00000191288 696 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm37578-201ENSMUST00000192256 1177 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Lrriq3-202ENSMUST00000192383 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm32347-201ENSMUST00000192944 696 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm7270-201ENSMUST00000195818 1128 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm37990-201ENSMUST00000195821 696 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Igkv13-73-1-201ENSMUST00000196767 200 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Mir1892-201ENSMUST00000197752 80 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm30735-201ENSMUST00000199488 726 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 AC099934.1-201ENSMUST00000200493 79 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm21048-201ENSMUST00000202470 1166 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm18422-201ENSMUST00000203663 1032 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Il5ra-203ENSMUST00000205004 2271 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Olfr1479-ps1-201ENSMUST00000207752 382 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm45345-201ENSMUST00000211427 555 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 AC159379.1-201ENSMUST00000218192 620 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm19056-201ENSMUST00000218220 797 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm33308-202ENSMUST00000218566 652 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 AC133598.2-201ENSMUST00000224302 624 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 AC124450.1-201ENSMUST00000225569 495 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
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Gm28047Q3US59 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Bglap3-201ENSMUST00000075523 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Awat1-201ENSMUST00000096361 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Olfr111-201ENSMUST00000097325 1041 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Tmem68-201ENSMUST00000029891 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 9230020A06Rik-201ENSMUST00000151841 2051 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
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Gm28047Q3US59 Tmem167-203ENSMUST00000161568 8689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
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Gm28047Q3US59 Krcc1-202ENSMUST00000168700 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Fam107a-203ENSMUST00000121887 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Speer4e-201ENSMUST00000159973 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 AC130217.2-201ENSMUST00000224009 2990 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
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Gm28047Q3US59 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Olfr1001-ps1-201ENSMUST00000121340 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Gm22025-201ENSMUST00000122734 302 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Gm15322-201ENSMUST00000142621 739 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Gm24239-201ENSMUST00000157791 255 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Gm25332-201ENSMUST00000158038 105 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
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Gm28047Q3US59 Gm3585-201ENSMUST00000173438 875 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Gm24300-201ENSMUST00000177809 109 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Gm24017-201ENSMUST00000178726 109 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Gm23952-201ENSMUST00000179380 109 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Gm8993-201ENSMUST00000182182 983 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Gm8614-201ENSMUST00000182528 978 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Gm29322-201ENSMUST00000185378 582 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Gm28113-201ENSMUST00000188280 229 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Gm29508-202ENSMUST00000191414 710 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Gm17953-201ENSMUST00000192061 667 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Ranbp2-ps12-201ENSMUST00000197110 386 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Gm32585-201ENSMUST00000198586 764 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 4930513N20Rik-201ENSMUST00000207466 1265 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Gm5176-201ENSMUST00000218244 1227 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Gm19233-201ENSMUST00000219772 936 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms