Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Agbl2-202ENSMUST00000037219 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm28432-201ENSMUST00000185237 1499 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm28081-201ENSMUST00000185321 1497 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm29473-201ENSMUST00000185588 1497 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm29662-201ENSMUST00000185620 1499 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm28082-201ENSMUST00000185683 1499 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm29061-201ENSMUST00000185900 1499 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm28679-201ENSMUST00000186013 1499 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm29565-202ENSMUST00000186260 1499 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm28338-202ENSMUST00000186269 1499 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm28668-202ENSMUST00000186549 1499 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm29321-201ENSMUST00000186727 1499 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm28135-201ENSMUST00000186847 1499 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm29158-201ENSMUST00000186883 1494 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm28291-202ENSMUST00000186921 1499 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm29393-201ENSMUST00000187002 1499 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm29219-201ENSMUST00000187224 1499 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm29547-201ENSMUST00000187258 1499 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm28260-201ENSMUST00000187337 1499 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm28225-201ENSMUST00000187730 1499 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm29569-202ENSMUST00000187955 1499 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm29625-201ENSMUST00000188079 1499 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm28735-202ENSMUST00000188159 1499 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm29297-202ENSMUST00000188186 1499 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm29457-201ENSMUST00000188224 1499 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm29190-201ENSMUST00000188255 1499 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm28236-203ENSMUST00000188311 1499 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm28197-203ENSMUST00000188434 1499 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm29070-202ENSMUST00000188541 1499 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm28545-201ENSMUST00000188667 1499 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm29265-201ENSMUST00000188697 1499 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm28947-203ENSMUST00000188701 1499 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm29616-201ENSMUST00000188777 1499 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm29162-202ENSMUST00000188893 1499 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm28606-201ENSMUST00000188938 1499 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm29338-201ENSMUST00000189318 1499 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm29425-202ENSMUST00000189421 1499 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm29271-203ENSMUST00000189943 1499 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm29381-201ENSMUST00000190168 1497 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm28454-203ENSMUST00000190183 1495 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm28842-202ENSMUST00000190289 1499 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm28259-201ENSMUST00000190319 1497 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm28318-203ENSMUST00000190347 1499 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm28633-202ENSMUST00000190867 1485 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm29182-202ENSMUST00000191008 1499 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm28632-202ENSMUST00000191193 1499 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm28245-203ENSMUST00000191551 1495 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm38370-201ENSMUST00000192545 1499 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm37462-201ENSMUST00000193386 1498 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm32114-203ENSMUST00000195759 1499 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm19368-201ENSMUST00000221258 4424 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 6330410L21Rik-201ENSMUST00000199846 3871 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm37289-201ENSMUST00000195409 1402 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Enpp2-202ENSMUST00000167541 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm45179-201ENSMUST00000208452 4337 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Speer4a-201ENSMUST00000079447 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm26740-202ENSMUST00000181532 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 AC160029.1-201ENSMUST00000219628 2678 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Olfr361-201ENSMUST00000100145 969 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Zfp971-201ENSMUST00000108925 923 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 1700006E09Rik-201ENSMUST00000010985 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Swi5-204ENSMUST00000113400 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm7146-201ENSMUST00000116079 739 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm25782-201ENSMUST00000122526 289 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 1700057H21Rik-201ENSMUST00000152467 383 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm26346-201ENSMUST00000157525 329 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm24741-201ENSMUST00000158857 106 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm20453-201ENSMUST00000173968 226 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 1700006E09Rik-203ENSMUST00000176722 608 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm28527-201ENSMUST00000185210 297 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 1700044C05Rik-201ENSMUST00000186060 898 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Ighv3-2-201ENSMUST00000191842 349 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm42716-201ENSMUST00000196003 680 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm18422-201ENSMUST00000203663 1032 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm45008-201ENSMUST00000206420 493 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm4083-201ENSMUST00000207158 451 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm44809-201ENSMUST00000208305 993 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Olfr562-ps1-201ENSMUST00000210779 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm8523-201ENSMUST00000211386 552 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm34263-202ENSMUST00000214353 303 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 1700019C18Rik-202ENSMUST00000221688 1047 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 AC133203.1-201ENSMUST00000228241 301 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Olfr564-201ENSMUST00000061096 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Olfr149-201ENSMUST00000082027 1030 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Zfp970-201ENSMUST00000099002 794 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm14391-201ENSMUST00000099028 473 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm21093-201ENSMUST00000084677 1710 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 A730017C20Rik-205ENSMUST00000165666 1911 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Fanci-201ENSMUST00000036865 4645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms