Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm29011-201ENSMUST00000191059 712 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 D3Ertd751e-212ENSMUST00000194346 744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 4930512P04Rik-201ENSMUST00000197000 424 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm5065-202ENSMUST00000207531 807 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm45646-201ENSMUST00000210983 441 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm45473-201ENSMUST00000211452 616 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Cx3cl1-205ENSMUST00000211947 377 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm33178-201ENSMUST00000212090 257 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm18592-201ENSMUST00000221529 276 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 4930550C14Rik-201ENSMUST00000005262 1237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Olfr481-201ENSMUST00000067143 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Zfp970-201ENSMUST00000099002 794 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm14391-201ENSMUST00000099028 473 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Fat4-201ENSMUST00000061260 16109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 9330111N05Rik-201ENSMUST00000180409 1407 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Vmn1r220-205ENSMUST00000228239 7849 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 AC158388.2-201ENSMUST00000223665 1314 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Clmn-201ENSMUST00000109936 11866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Asap1-205ENSMUST00000175793 4314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Ube4a-202ENSMUST00000117549 3415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Pln-206ENSMUST00000220197 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 4933440M02Rik-201ENSMUST00000061823 3801 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Dnah2-201ENSMUST00000035539 13569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Robo2-203ENSMUST00000117785 8124 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Tet2-201ENSMUST00000098603 9179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Olfr619-202ENSMUST00000215732 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Dnah6-204ENSMUST00000204053 12435 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Mbtd1-204ENSMUST00000107852 1930 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Hephl1-201ENSMUST00000159985 5261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Ryr3-201ENSMUST00000080673 15422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Vmn1r31-203ENSMUST00000177318 2076 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Zfp850-202ENSMUST00000180024 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm4070-201ENSMUST00000106766 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gvin1-201ENSMUST00000006667 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 C87499-202ENSMUST00000107142 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm11624-201ENSMUST00000118579 1041 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Mup-ps16-201ENSMUST00000120085 596 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 M6pr-ps-201ENSMUST00000120481 830 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm14325-202ENSMUST00000150650 310 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm15511-201ENSMUST00000152570 557 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Olfr331-202ENSMUST00000170501 957 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm22690-201ENSMUST00000175054 110 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 1700029M03Rik-202ENSMUST00000187517 357 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm8282-201ENSMUST00000187559 483 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm45054-201ENSMUST00000206525 342 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm44930-201ENSMUST00000207545 489 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 AC105169.1-201ENSMUST00000218912 1294 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 AC079681.1-201ENSMUST00000219437 639 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm9292-201ENSMUST00000222008 710 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm19195-201ENSMUST00000222018 511 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 CT030254.1-201ENSMUST00000225450 1078 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 AC166574.7-201ENSMUST00000228502 704 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Uqcrh-ps1-201ENSMUST00000038391 270 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Olfr836-201ENSMUST00000074986 955 ntAPPRIS P2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Olfr331-201ENSMUST00000081743 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm24454-201ENSMUST00000083349 132 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Tmprss11b-201ENSMUST00000038448 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Aox3-201ENSMUST00000040999 4606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Olfr1273-ps-201ENSMUST00000214356 4698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Olfr237-ps1-203ENSMUST00000216411 4115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Atp8a2-201ENSMUST00000080368 12886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gp6-202ENSMUST00000206928 5900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Abi3bp-201ENSMUST00000048471 4687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Olfr553-202ENSMUST00000216776 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Vmn1r39-208ENSMUST00000228919 2105 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Rpgrip1l-201ENSMUST00000047783 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Slc24a2-204ENSMUST00000107158 10499 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm12099-201ENSMUST00000118660 750 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm16074-201ENSMUST00000119524 444 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm15194-201ENSMUST00000120453 434 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
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