Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Olfr730-201ENSMUST00000051453 957 ntAPPRIS P2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Klra7-203ENSMUST00000088011 921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Cox11-202ENSMUST00000099960 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Mat2a-201ENSMUST00000059472 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm37311-201ENSMUST00000195541 2024 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Rapgef6-201ENSMUST00000094536 3372 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Rpgrip1l-201ENSMUST00000047783 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Olfr1138-202ENSMUST00000214573 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Zfp955b-201ENSMUST00000099414 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Pias1-201ENSMUST00000098651 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm43469-201ENSMUST00000196084 4634 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Brinp3-201ENSMUST00000074622 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm37880-201ENSMUST00000192216 3257 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 AC155298.1-201ENSMUST00000225350 3250 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm3453-201ENSMUST00000170686 1756 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Vmn1r181-203ENSMUST00000226978 4371 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm37725-201ENSMUST00000193965 2125 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RxraP28700 Adgrg2-203ENSMUST00000112401 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RxraP28700 Adgrg2-204ENSMUST00000112402 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RxraP28700 Adgrg2-205ENSMUST00000112404 4601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RxraP28700 Adgrg2-206ENSMUST00000112405 4634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RxraP28700 Vmn1r31-203ENSMUST00000177318 2076 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RxraP28700 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RxraP28700 AC132465.1-201ENSMUST00000219938 1307 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm44215-201ENSMUST00000204910 2711 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RxraP28700 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RxraP28700 Cntn4-201ENSMUST00000079416 2844 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RxraP28700 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RxraP28700 Zfp935-202ENSMUST00000221747 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RxraP28700 Mup3-203ENSMUST00000107488 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm15901-201ENSMUST00000117663 941 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RxraP28700 Spink8-201ENSMUST00000118732 637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm8855-201ENSMUST00000118888 878 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm14788-201ENSMUST00000119457 375 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm14489-201ENSMUST00000120868 901 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm5392-201ENSMUST00000122189 789 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm12239-201ENSMUST00000134285 500 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm22604-201ENSMUST00000157604 311 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm4202-201ENSMUST00000169025 733 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm28501-201ENSMUST00000188729 421 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm4035-201ENSMUST00000189445 399 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm43464-201ENSMUST00000198003 317 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm36696-201ENSMUST00000205418 438 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RxraP28700 Olfr1295-201ENSMUST00000207283 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RxraP28700 AC165245.1-201ENSMUST00000214181 636 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RxraP28700 CT030124.1-201ENSMUST00000217130 235 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm7557-201ENSMUST00000221935 865 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RxraP28700 AC132239.1-201ENSMUST00000223157 773 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RxraP28700 AC154250.1-201ENSMUST00000224775 489 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RxraP28700 Olfr1387-201ENSMUST00000073824 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RxraP28700 Olfr98-201ENSMUST00000080759 1039 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm23058-201ENSMUST00000093703 107 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RxraP28700 Lypd6-205ENSMUST00000169232 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RxraP28700 Pbrm1-202ENSMUST00000022474 4843 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RxraP28700 Olfr1285-202ENSMUST00000220153 1430 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm17017-201ENSMUST00000161540 2405 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm9602-201ENSMUST00000163325 2062 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm8356-201ENSMUST00000163636 2062 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RxraP28700 Vmn1r90-208ENSMUST00000227788 7018 ntAPPRIS P2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RxraP28700 Vmn2r-ps159-201ENSMUST00000074107 2716 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RxraP28700 Olfr1087-202ENSMUST00000214141 3861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RxraP28700 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RxraP28700 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RxraP28700 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm18757-201ENSMUST00000207938 3141 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RxraP28700 Frem2-201ENSMUST00000091137 12348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RxraP28700 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm44068-201ENSMUST00000204049 2128 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RxraP28700 Ccdc146-202ENSMUST00000115245 3389 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm28472-202ENSMUST00000190133 1499 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm28789-202ENSMUST00000190429 1499 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RxraP28700 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RxraP28700 Adgrg2-207ENSMUST00000112408 4708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RxraP28700 Rgsl1-203ENSMUST00000141249 1752 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RxraP28700 Olfr771-202ENSMUST00000214271 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RxraP28700 Adgrg2-202ENSMUST00000112400 4682 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RxraP28700 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm43386-201ENSMUST00000199654 4001 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RxraP28700 Mir711-201ENSMUST00000102188 82 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm26340-201ENSMUST00000102365 99 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm14930-201ENSMUST00000118864 652 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm12565-201ENSMUST00000119004 649 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm14863-201ENSMUST00000119648 307 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm15502-201ENSMUST00000121449 208 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RxraP28700 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm11368-201ENSMUST00000139576 609 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RxraP28700 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm10603-203ENSMUST00000184875 508 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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