Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm12051-201ENSMUST00000147771 1341 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Ect2-207ENSMUST00000176242 3985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Tcf12-221ENSMUST00000185117 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Sfmbt2-205ENSMUST00000116594 7821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Atp2b4-201ENSMUST00000048953 8292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Mug-ps1-202ENSMUST00000189975 3293 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Nxt2-204ENSMUST00000112916 2532 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm37790-201ENSMUST00000193136 3346 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm44898-201ENSMUST00000205934 2223 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Eif2ak2-201ENSMUST00000024884 4313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Kng1-201ENSMUST00000023589 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gpr119-201ENSMUST00000053970 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Alcam-203ENSMUST00000164728 1885 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Mdc1-201ENSMUST00000082337 7335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtpraP18052 E230015B07Rik-202ENSMUST00000159884 2822 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Olfr1513-202ENSMUST00000215147 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm44185-201ENSMUST00000204539 3307 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Frem1-202ENSMUST00000107230 9690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm20706-201ENSMUST00000175985 2023 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm15093-201ENSMUST00000179021 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm37925-201ENSMUST00000195352 4255 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Btnl10-202ENSMUST00000069941 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Vmn2r104-201ENSMUST00000168050 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 C030015A19Rik-201ENSMUST00000203368 2551 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Olfr396-ps1-201ENSMUST00000143750 1675 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm43719-201ENSMUST00000200088 2199 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Sox6-205ENSMUST00000169129 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Sncaip-206ENSMUST00000178678 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 4930594C11Rik-201ENSMUST00000192316 2755 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Zfp971-201ENSMUST00000108925 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm15971-201ENSMUST00000119372 211 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm12587-201ENSMUST00000120180 427 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm8051-201ENSMUST00000120464 466 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm15527-202ENSMUST00000144094 770 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Znrd1-203ENSMUST00000172823 454 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm18833-201ENSMUST00000173218 862 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm20389-201ENSMUST00000174217 1006 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm27854-201ENSMUST00000175578 244 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm6061-201ENSMUST00000175860 492 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm25065-201ENSMUST00000177914 132 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm25891-201ENSMUST00000180050 132 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm26665-201ENSMUST00000181378 839 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm29353-201ENSMUST00000185801 620 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Ighv1-27-201ENSMUST00000194473 340 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 n-TStga1-201ENSMUST00000199903 109 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm44243-201ENSMUST00000204323 692 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Rpl7a-ps14-201ENSMUST00000205097 790 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm7570-201ENSMUST00000215246 698 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 AC154450.1-201ENSMUST00000220911 485 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Mylf-ps-201ENSMUST00000222174 421 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 AC105950.1-201ENSMUST00000222637 408 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 AC167192.4-201ENSMUST00000224087 993 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 AC140288.1-201ENSMUST00000226329 503 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 AC108945.1-201ENSMUST00000226477 94 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Glycam1-203ENSMUST00000228060 528 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Vmn1r22-205ENSMUST00000228322 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Vmn1r233-201ENSMUST00000056339 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Olfr1145-201ENSMUST00000079711 945 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm24035-201ENSMUST00000082867 107 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Zfp970-201ENSMUST00000099002 794 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm14391-201ENSMUST00000099028 473 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Prkd3-201ENSMUST00000003191 5517 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm14406-202ENSMUST00000108945 1348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Pcdh17-201ENSMUST00000071370 11451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Snx10-207ENSMUST00000179365 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Gm37169-201ENSMUST00000195599 4161 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PtpraP18052 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms