Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Actrt1-201ENSMUST00000059466 1339 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Kcnrg-202ENSMUST00000225582 1821 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Cnot2-203ENSMUST00000105267 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm34004-201ENSMUST00000215460 2837 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm43361-201ENSMUST00000196562 4690 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Enpp2-202ENSMUST00000167541 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Usp29-204ENSMUST00000200535 7540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Olfr770-202ENSMUST00000203887 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm44660-201ENSMUST00000207134 2465 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 C230085N15Rik-201ENSMUST00000194893 4327 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm20826-202ENSMUST00000185348 4605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Cts8-201ENSMUST00000021891 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm35940-201ENSMUST00000213355 4797 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm3424-201ENSMUST00000164585 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm3182-201ENSMUST00000167902 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Hnf4g-202ENSMUST00000108394 2327 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Scn2a-201ENSMUST00000028377 8935 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Lair1-202ENSMUST00000086400 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Kcnma1-208ENSMUST00000177634 4605 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Mir1960-201ENSMUST00000157488 78 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Ccl27b-201ENSMUST00000177785 425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm37135-201ENSMUST00000192652 534 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm43779-201ENSMUST00000196691 829 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm44316-201ENSMUST00000199274 97 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Tas2r111-ps2-201ENSMUST00000203794 901 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm18689-201ENSMUST00000203969 902 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Olfr1476-ps1-201ENSMUST00000208572 367 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm45733-201ENSMUST00000212988 437 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Olfr644-201ENSMUST00000077417 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 B020031M17Rik-201ENSMUST00000080505 522 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm23686-201ENSMUST00000083241 164 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Vmn1r168-201ENSMUST00000098704 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm37880-201ENSMUST00000192216 3257 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm43788-201ENSMUST00000201539 2417 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Olfr2-205ENSMUST00000214105 5798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Vmn1r87-204ENSMUST00000228800 1993 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Il7r-201ENSMUST00000003981 3540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm29438-201ENSMUST00000191298 2613 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Xpo7-202ENSMUST00000167242 15121 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm15910-201ENSMUST00000127564 2971 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Naip5-201ENSMUST00000049789 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Cse1l-210ENSMUST00000168599 2748 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Atp2c1-202ENSMUST00000085133 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Svs2-202ENSMUST00000109374 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Cyp4a28-ps-201ENSMUST00000121884 1477 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 AC162908.1-201ENSMUST00000219164 4563 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm5039-202ENSMUST00000218054 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm2080-201ENSMUST00000211299 1573 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Ncoa7-212ENSMUST00000217644 2256 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 S100a1-202ENSMUST00000107340 577 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Klra3-202ENSMUST00000111998 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Swi5-204ENSMUST00000113400 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm11445-201ENSMUST00000119101 532 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm15181-201ENSMUST00000120142 177 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm13991-201ENSMUST00000120190 648 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm12804-201ENSMUST00000121030 999 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm29395-201ENSMUST00000188551 1049 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Fcer1a-202ENSMUST00000193017 826 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm37381-202ENSMUST00000194643 657 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm43838-201ENSMUST00000196357 348 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Ass-ps1-201ENSMUST00000197717 761 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm43132-201ENSMUST00000199106 792 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 S100a14-203ENSMUST00000199538 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm45259-201ENSMUST00000209217 1006 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 CT485607.3-201ENSMUST00000213361 672 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Fkbp1a-ps2-201ENSMUST00000219474 311 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm33489-201ENSMUST00000223171 673 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Olfr1440-201ENSMUST00000054567 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Olfr794-201ENSMUST00000059957 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm6104-201ENSMUST00000078030 603 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Platr26-201ENSMUST00000079720 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm26442-201ENSMUST00000082588 153 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Cox11-202ENSMUST00000099960 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm42998-201ENSMUST00000197053 2371 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Olfr736-204ENSMUST00000215227 2485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm4994-201ENSMUST00000118379 2187 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Zfp758-202ENSMUST00000088765 2973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Olfr1270-203ENSMUST00000215578 4982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms