Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm10727-201ENSMUST00000197107 1602 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Igkv11-125-201ENSMUST00000103311 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm26016-201ENSMUST00000104403 129 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 H2al2a-201ENSMUST00000105001 542 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Zfp971-201ENSMUST00000108925 923 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Zfp972-202ENSMUST00000108934 561 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Fancl-202ENSMUST00000109509 1187 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm15000-201ENSMUST00000118275 1243 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm13130-201ENSMUST00000119195 1166 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm13489-201ENSMUST00000121234 971 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 1700036O09Rik-201ENSMUST00000136834 349 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Ube2v1-207ENSMUST00000151365 924 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 1700080G11Rik-201ENSMUST00000156401 436 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm22882-201ENSMUST00000157749 124 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm16589-201ENSMUST00000159522 918 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 4930579O11Rik-202ENSMUST00000168243 672 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm17205-201ENSMUST00000168370 1207 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Svs6-201ENSMUST00000017144 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Vmn1r-ps79-201ENSMUST00000173508 963 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Vmn1r-ps70-201ENSMUST00000173675 963 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Vmn1r-ps146-201ENSMUST00000176131 525 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Pea15b-201ENSMUST00000182806 387 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm28703-201ENSMUST00000185312 1159 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm9999-202ENSMUST00000185832 335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm29377-201ENSMUST00000185892 1161 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm28788-201ENSMUST00000189717 375 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm29558-201ENSMUST00000190134 375 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm28070-201ENSMUST00000191502 445 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm7369-201ENSMUST00000192738 936 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm2979-201ENSMUST00000193442 463 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm37260-201ENSMUST00000193748 1251 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm42753-201ENSMUST00000196718 1268 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 2200002A13Rik-201ENSMUST00000206633 709 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm17992-201ENSMUST00000207346 1072 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Olfr706-201ENSMUST00000209025 1087 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm35998-201ENSMUST00000212862 838 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Olfr1073-ps1-202ENSMUST00000215705 478 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm46311-201ENSMUST00000217971 203 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 AC159472.1-201ENSMUST00000218178 463 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm19217-201ENSMUST00000218238 328 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 AC122539.1-201ENSMUST00000219925 329 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm34215-201ENSMUST00000221599 355 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 9130015A21Rik-202ENSMUST00000222153 837 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Zfp429-203ENSMUST00000224684 524 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 AC124729.1-202ENSMUST00000225587 938 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm21762-202ENSMUST00000225881 830 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 AC138604.2-201ENSMUST00000226620 921 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Ly6g-201ENSMUST00000023246 336 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Dbi-201ENSMUST00000027634 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 2310030G06Rik-201ENSMUST00000034564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Fate1-201ENSMUST00000066116 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Vmn1r236-201ENSMUST00000066998 1121 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm25404-201ENSMUST00000082970 107 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm23452-201ENSMUST00000083327 107 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm24254-201ENSMUST00000083702 104 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm25189-201ENSMUST00000083911 164 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Olfr262-201ENSMUST00000087818 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Mir455-201ENSMUST00000093594 82 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm10665-201ENSMUST00000098720 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm10670-201ENSMUST00000098744 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm26545-201ENSMUST00000181082 1746 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Elf1-204ENSMUST00000227192 3765 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm43588-201ENSMUST00000201862 2298 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Olfr1131-203ENSMUST00000216756 1459 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 AC122346.1-201ENSMUST00000225266 3732 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Lonrf2-201ENSMUST00000039612 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 AC156636.1-201ENSMUST00000218639 2229 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm5447-201ENSMUST00000070258 1773 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Stt3a-201ENSMUST00000120381 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Olfr43-204ENSMUST00000215550 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Glrp1-201ENSMUST00000067625 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Tor1aip1-210ENSMUST00000169241 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm37984-201ENSMUST00000191641 3733 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Olfr48-202ENSMUST00000214428 3848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Olfr1508-202ENSMUST00000206520 5791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Zfp930-204ENSMUST00000212681 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 AC154642.2-201ENSMUST00000223657 2485 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gcsam-201ENSMUST00000023339 3315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm15169-201ENSMUST00000126095 2753 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm25757-201ENSMUST00000103986 123 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Uros-202ENSMUST00000106144 1045 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm15217-201ENSMUST00000111826 733 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Rpl36a-201ENSMUST00000113211 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm16394-201ENSMUST00000117289 675 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Cabyr-203ENSMUST00000119108 818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm15923-201ENSMUST00000119300 1169 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm12844-201ENSMUST00000119463 582 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Mup-ps21-201ENSMUST00000119998 448 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm12044-201ENSMUST00000120335 213 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm24498-201ENSMUST00000158445 102 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm8837-201ENSMUST00000161037 1107 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm17542-201ENSMUST00000169859 99 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms