Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm8855-201ENSMUST00000118888 878 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Vamp7-ps-201ENSMUST00000120334 655 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm14156-201ENSMUST00000121538 483 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm16224-201ENSMUST00000127711 412 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm23954-201ENSMUST00000157213 353 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r139-202ENSMUST00000173668 753 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Rps19-ps8-201ENSMUST00000180714 422 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm29594-201ENSMUST00000191181 398 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Fbxw27-201ENSMUST00000197125 810 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm43348-201ENSMUST00000197867 530 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm19104-201ENSMUST00000198392 679 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm4860-201ENSMUST00000200368 454 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm44003-201ENSMUST00000203024 490 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm45479-201ENSMUST00000211613 802 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Cyp3a61-ps1-201ENSMUST00000218470 592 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm4928-201ENSMUST00000219622 850 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm9321-201ENSMUST00000221179 778 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 AC108437.1-201ENSMUST00000222170 776 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm2754-201ENSMUST00000223383 589 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 AC154849.2-201ENSMUST00000223781 974 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 AC154250.1-201ENSMUST00000224775 489 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 AC098742.1-201ENSMUST00000227945 373 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Pbsn-201ENSMUST00000000003 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Olfr509-201ENSMUST00000061690 1075 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1351-201ENSMUST00000080730 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Serpinb5-203ENSMUST00000112730 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm44043-201ENSMUST00000203426 3253 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1340-204ENSMUST00000217334 2001 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm15228-201ENSMUST00000142044 3440 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Mcf2-201ENSMUST00000033478 3659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Oas2-202ENSMUST00000081491 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 4931423N10Rik-202ENSMUST00000114505 1392 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1311-203ENSMUST00000215321 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 AC168056.3-201ENSMUST00000225395 2540 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm3476-202ENSMUST00000167913 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm3149-202ENSMUST00000171810 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Parp4-201ENSMUST00000161553 6387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Fstl5-203ENSMUST00000160261 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 A930017M01Rik-201ENSMUST00000081361 2884 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1054-202ENSMUST00000213205 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm34921-201ENSMUST00000219528 1406 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm17056-201ENSMUST00000164804 2299 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm23527-201ENSMUST00000104570 130 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm12842-201ENSMUST00000117298 476 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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Cldn34c3J3QJW5 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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Cldn34c3J3QJW5 Gm12910-201ENSMUST00000135902 724 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm25550-201ENSMUST00000158079 128 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm16226-201ENSMUST00000159950 760 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm18415-201ENSMUST00000177464 647 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm27617-201ENSMUST00000184321 168 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm18447-201ENSMUST00000187501 307 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm28289-201ENSMUST00000189331 315 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm43391-203ENSMUST00000198110 1001 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm16571-202ENSMUST00000203839 585 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Olfr189-ps1-201ENSMUST00000205310 804 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm4548-201ENSMUST00000208487 509 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm44954-201ENSMUST00000208513 227 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Ldhc-204ENSMUST00000210585 1071 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm9685-201ENSMUST00000211275 538 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm7769-201ENSMUST00000212900 933 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm45789-201ENSMUST00000213038 364 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Noxred1-201ENSMUST00000021423 1101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Olfr589-202ENSMUST00000218483 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.1 ms